#NEXUS [Data set from Miyamoto et al., 1999, Systematic Biology. Multiple alignment of the complete c-myc coding sequences for the 18 species of the eutherian study group and two representatives of the avian outgroup. These sequences are presented as sets of triplets that begin and end with the start and stop codons of their mRNAs. As highlighted by the exclamation point, positions 1-814 correspond to exon 2, whereas sites 815-1389 refer to exon 3. The sequence for Ovis is shown in its entirety, with periods used in the other species to denote matches to this reference. Gaps are indicated by dashes, whereas question marks signify the lack of a comparable sequence of exon 2 for Serinus.] Begin data; Dimensions ntax= 20 nchar= 1389; Format datatype= DNA interleave gap= - matchchar= .; Matrix [ 1 78] Ovis ATG CCC CTC AAC GTC AGC TTC GCC --- AAC AGA AAC TAT GAC CTC GAC TAC GAT TCG GTG CAG CCT TAT TTC TAC TGC Sus ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... Canis ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Felis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... Pteropus ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... Tadarida ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ..A A.. ... ..C ... ... .T. ... Cynocephalus ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... G.. T.G ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Sylvilagus ... ... ... ... ... ... ... ... ACC ... ..G ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... Callithrix ... ... ... ... ... ... ... AG. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Gorilla ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Homo ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Hylobates ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Pan ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Pongo ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Marmota ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... Mus ... ... ... ... ..G .A. ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..A ... ..C ... ... AT. ... Rattus ... ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... AT. ... Tupaia ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ... ... ... ... Gallus ... ..G ... .G. .C. ... C.. C.. ... .G. .AG ... ..C ..T TA. ... ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... .T. Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 79 156] Ovis GAC GAG GAG GAG --- AAC TTC TAC --- --- CAC CAG CAG CAG CAG AGC GAA CTG CAG CCG CCG GCG CCC AGC GAG GAC Sus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T Canis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Felis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Pteropus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Tadarida ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T Cynocephalus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ..M ... ... ... ... ... ..T Sylvilagus ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T Callithrix ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... ..T Gorilla ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T Homo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T Hylobates ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T Pan ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T Pongo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ..T Marmota ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T Mus ... ... ..A ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ..T ... ..T Rattus ... ... ..A ... ... ..T ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..A ... ..T ... ..T Tupaia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T Gallus ..G ... ... ... GAG ... ... ... CTG GCG GCG ... ... .G. GGC ... ..G ... ... ..T ..C ..C ..G TC. ... ... Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 157 234] Ovis ATC TGG AAG AAA TTC GAG CTG CTG CCC ACC CCG CCC CTG TCC CCT AGC CGC CGC TCC GGG CTC TGC TCG CCG TCG TAC Sus ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Canis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Felis ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ..C ... Pteropus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Tadarida ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..G ..G ... ... ... ..G ..A ..T ... ... ..C ..C ... Cynocephalus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Sylvilagus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C ..C ... Callithrix ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ... ... A.C ..C .G. Gorilla ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... Homo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Hylobates ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Pan ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Pongo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Marmota ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T C.C .GT Mus ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ..C ..T Rattus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ..T Tupaia ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ... Gallus ... ... ... ..G ..T ... ..C ... ... ..G ... ... ..C ..G ..C ... ... ... ... A.C ..G --- --- --- --- --- Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 235 312] Ovis GTC GCG GTC --- GCC TCC TTC TCG CCC AGG GGA GAC GAC GAC GGC GGC GGC GGC AGC TTT TCC TCC GCG GAC CGG TTG Sus ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... A.G ..C ... .A. ... Canis ... ..A ... ... ..G ... ... ..C ... C.. ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... A.. ..C ... .A. ... Felis ... ..C T.. ... ..G ... ... ..C ... C.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.G ..C ... .A. ... Pteropus ..T ..T .CG TTC ..G ... ... ..C ... ... .AC ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..G ..C ... .A. C.. Tadarida ... ... T.. ... ..T ... ... ..A ... ... .AC .TT ... ... ... ..T ... ... ... ... ... A.. ..A ... .A. ... Cynocephalus ..T ..T ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... A.G ..C ... .A. C.. Sylvilagus ..T ..C ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ..C ... A.G ..T ... .A. C.. Callithrix ..T T.A ... ... A.G C.. ... ..C ..T C.T ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..C ... A.T ..C ... .A. C.. Gorilla ..T ... ... ... A.G C.. ... ..C ..T C.. ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..C ... A.G ..C ... .A. C.. Homo ..T ... ... ... A.A C.. ... ..C .TT C.. ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..C ... A.G ..C ... .A. C.. Hylobates ..T ... ... ... A.G C.. ... ..C ..T C.. ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..C ... A.G ..C ... .A. C.. Pan ..T ... ... ... A.G C.. ... ..C .TT C.. ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..C ... A.G ..C ... .A. C.. Pongo ..T ... ... ... A.G C.. ... ..C ..T C.. ... ... A.. ... ... ..T ... ..G ... ..C ... A.G ..C ... .A. C.. Marmota ..T A.. ... ... ..G ..T ... ..C ... CC. ... ... ... ..T ..T ... ... ... ..T ..C ... A.A ..C ... .A. C.. Mus ..T ... ... GCT A.G ... ... ..C ..A ... .A. ... ..T ... ... ... ..T ... .A. ..C ... A.. ..C ..T .A. C.. Rattus ... ... ... GCT A.G ... ... ..C ..A ... .AG ... ..T ... ..T ... ..T ... .A. ..C ... A.. ..C ..T .A. C.. Tupaia ..A ..C ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... A.. ..C ... .A. C.. Gallus --- --- .C. GCC ... ... .G. .TC ..T --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ... A.. ..C ... .A. C.. Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 313 390] Ovis GAG ATG GTG ACC GAG CTG CTG GGA GGC GAC ATG GTG AAC CAG AGC TTC ATC TGC GAC CCC GAC GAT GAG ACC CTC ATC Sus ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... T.. ... Canis ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Felis ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Pteropus ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Tadarida ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... T.. ... Cynocephalus ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ..T Sylvilagus ... ... ..C ... ... ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Callithrix ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Gorilla ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Homo ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Hylobates ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Pan ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Pongo ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Marmota ... ... ... ... ... ... T.. ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ..T Mus ... ... A.. ... ... T.A ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ..C ... ... T.. ... Rattus ... ... A.. ... ... ..A ..T ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... T.. ... Tupaia ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... T.. ... Gallus ... ... ... ..G ... ... ..C ..G ..G ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ..A T.. T.. G.. Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 391 468] Ovis AAA AAC ATC ATC ATC CAG GAC TGT ATG TGG AGC GGC TTC TCG GCC GCC GCC AAG CTC --- --- --- GTC TCG GAG AAG Sus ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... Canis ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Felis ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Pteropus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Tadarida ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... Cynocephalus ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... ... Sylvilagus ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Callithrix ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Gorilla ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Homo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Hylobates ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... Pan ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Pongo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... Marmota ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Mus ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ..T ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... Rattus ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ..G ... ... ... ... ..C ... ... Tupaia ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... Gallus ... TC. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G GAG AAG GTG ..G ... ... ... Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 469 546] Ovis CTG GCC TCT TAC CAG GCT GCG CGC AAA GAC GGC GGC AGC CCG AGC CCC GCC CGC GGG --- --- --- --- --- --- --- Sus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .TT ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Canis ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... Felis ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Pteropus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tadarida ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... G.. .G. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... Cynocephalus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. A.. ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... Sylvilagus ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... A.. A.. ... ... ... ... ... ... .TC ... ... ... ... ... ... ... Callithrix ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. A.. ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Gorilla ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... .T. .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Homo ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Hylobates ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. A.. ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Pan ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Pongo ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Marmota ... ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... AC. ... T.. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... Mus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. AC. ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Rattus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. AC. ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tupaia ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Gallus ..C ... A.C ... ..A ..C T.C ... CGG ..G ..G ... CC. G.C GC. G.. T.. ..A CCC GGC CCG CCG CCC TCG GGG CCG Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 547 624] Ovis --- --- --- --- CAC GGC GGC TGC TCC ACC TCC AGC TTG TAC CTG CAG GAC CTG AGC GCC GCC GCC TCT GAA TGC ATC Sus ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... Canis ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... Felis ... ... ... ... .C. ..A ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ..C ..G ... ... Pteropus ... ... ... ... ... A.. .C. ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... Tadarida ... ... ... ... ..A ... .C. ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..G ..A .T. ..C ..G ... ... Cynocephalus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... Sylvilagus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... Callithrix ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... Gorilla ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ..A ..G ... ... Homo ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... Hylobates ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... Pan ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... Pongo ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... Marmota ... ... ... ... ... A.. ... ... ... T.. ... ... C.C ... ..A ..A ... ... ... C.G CG. ..G ..C ..G ... ... Mus ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C .C. ... ... ..G ..C ..G ... ..T Rattus ... ... ... ... ... A.. .T. ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ..C .C. ... ..A ..G ..C ..G ... ... Tupaia ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... Gallus CCG CCT CCT CCC GC. ... CC. GC. G.. T.G G.. G.. C.C ... ... ..C ... ... G.A ... ..G ... G.C ..C ... ... Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 625 702] Ovis GAC CCC TCG GTG GTC TTC CCC TAC CCG CTC AAC GAC AGC AGC TCG CCC AAG CCC TGC GCC TCC CCG GAC TCC ACC GCC Sus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Canis ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ..G G.. ... Felis ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... G.. ... Pteropus ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tadarida ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... Cynocephalus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... ..T ... ... Sylvilagus ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..G C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ..A ... .G. ... Callithrix ... ... ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... .G. ... Gorilla ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ..G .AA ... ... .G. ... Homo ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ..G .AA ... ... .G. ... Hylobates ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ..G ... ... ... .G. ... Pan ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... C.. ..G .AA ... ... .G. ... Pongo ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... .T. ... ... T.. ... A.. ..G ..A ... ... .G. ... Marmota ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... Mus ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A T.. ..T A.. ..G T.C ..T ... ..G ... Rattus ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A T.. ..T A.. ..G T.C ..T ... ..G ... Tupaia ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... Gallus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..G --- C.. G.C ..G CG. --- --- --- --- --- --- --- --- --- Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 703 780] Ovis TTC TCC CCC TCC TCT GAC TCT CTG CTC TCC TCT GCT GAG TCC TCC CCG CGG GCC AGT CCC GAG CCC CTG GCT CTC CAC Sus ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..A ... .G. ... ... ..A ... T.. ... ... ... Canis ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ..G ..G ... Felis ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... Pteropus ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..G ..C .C. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... .TG ... ... Tadarida ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..G ..C .CC ... ... ..A A.. ... ..C ... ... ... ... ..A ... ... Cynocephalus ... ... ..G ... ..G ... ... ... ..G ... ..G A.C ..A ... ..T ... .A. ... ..C ... ... ... ... A.A ... ... Sylvilagus ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ..C AAC ... ... ..T ... ... ... ..C ..T ... ... ... .TG ... ..T Callithrix ... ... A.G ... ..G ... ... ... ... ... ..G A.G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... .TG ... ..T Gorilla ... ..T ..G ... ..G ..T ... ... ... ... ..G A.G ... ... ... ... .A. .G. ..C ... ... ... ... .TG ... ..T Homo ... ..T ..G ... ..G ..T ... ... ... ... ..G A.G ... ... ... ... .A. .G. ..C ... ... ... ... .TG ... ..T Hylobates ... ..T ..G ... ..G ..T ... ... ... ... ..G A.A ... ... ... ..T .A. ... ..C ..G ... ... ... .TG ... ..T Pan ... ..T ..G ... ..G ..T ... ... ... ... ..G A.G ... ... ... ... .A. .G. ..C ... ... ... ... .TG ... ..T Pongo ... ..T ..G ... ..G ..T ... ... ... ... ..G A.G ... ... ... ... .A. ... ..C ... ... ... ... .TG ... ..T Marmota ... ..T ..A ... ..G ... ... ... ... ... ..C A.G ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A .TG ... ... Mus ... ..T ..T ... ..G ... ..G ... ..G ... ..C --- ... ... ... ..A ... ... ..C ..T ... ... ..A .TG ..G ..T Rattus ... ..T T.T ... ..G ... ..G ... ..G ... ..C --- ... ... ... ..A ... ... .CC ..T ... ... ..A .TG ..G ..T Tupaia ... ... ..G ... ..G ... ..C ... ... ... ..C A.G ... ... ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... Gallus --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- .CC G.. C.G ..C G.C ... .AC ... .C. G.T ... --- ..G GGG Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? [ 781 !Exon 3 858] Ovis GAG GAG ACC CCA CCC ACG ACC AGC AGC GAC TCT GAG GAA GAA CAA GAG GAT GAG GAA GAA ATT GAT GTT GTC TCT GTG Sus ... ... ..A ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Canis ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ..T ... ... Felis ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..A ... ... ... ... ..C ..T ... ... Pteropus ... ... ..A ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Tadarida ... ... ..A ... ... ..C ... ... ..T ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... Cynocephalus ... ... ..A ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... Sylvilagus ..A ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..C ..T ... ... Callithrix ..A ... ..A ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..A ... --- ..C ... ..C ..T ... ... Gorilla ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Homo ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Hylobates ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Pan ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Pongo ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ... Marmota ... ... ..A ..G ..T ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... Mus ... ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... Rattus ..A ... ..A ..G ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..G ..G ... ... Tupaia ... ... ..A ..T ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ..A Gallus .TC ..C ..G ..G ... ... ... ... ... ... ..G ..A ... ... ... ..A ..A ..T ..G ... ..C ... ..C ..T A.A T.A Serinus ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ??? ..A ... ... ... ... ..A ..T ..G ... ... ... ... ..T A.A T.A [ 859 936] Ovis GAA AAG AGG CAA CCC CCT GCC AAA AGG TCA GAA TCG --- GGG TCA CCC TCT GCC GGC AGC CAC AGC AAA CCT CCT CAC Sus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Canis ... ..A ... ..G G.. ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ..T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Felis ..G ..A ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..A G.. ... ... ... ... ... ... Pteropus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..A ..T ... ... ... ... ... ... Tadarida ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... Cynocephalus ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Sylvilagus ... ... ... ..G ... T.C A.. ... ... ... --- --- ... ... ... ..A ... ..A ..G G.. ... ... ... ... ..A ... Callithrix ... ... ... ..G ..T ... .G. ... ... ... ..G ..A ... ..A ... ... ... T.T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Gorilla ... ... ... ..G G.T ... .G. ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ..T ... .TT ..A G.. ..T ... ... ... ... ... Homo ... ... ... ..G G.T ... .G. ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ..T ... ..T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Hylobates ... ... ... ..G G.T ... AG. ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ..T ... ..T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Pan ... ... ... ..G G.T ... .G. ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ..T ... ..T ..A G.. ... ... ... ... ... ... Pongo ... ... ... ..G G.T ... .G. ... ... ... ..G ..T ... ..A ... ..T ... ..T ..A G.. ... .T. ... ... ... ... Marmota ... ... ..A ..G ..T T.. ... .G. ... ... ... ... ... .T. ... ... C.A ..A ..A ... ... ... ... ... ... ... Mus ..G ... ... ... A.. ... ... ..G ... ..G ..G ... ... ..C ... T.T C.A TT. C.A G.. ... ... ..G ... ..G ... Rattus ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ..G ..A ... ... ... T.. C.A T.A A.A G.. ... ... ... ... ..A ... Tupaia ... ... ... ..G ..T ... A.. ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ..T ..A G.. ... ... ... ..C ... ... Gallus .CT G.A GC. A.C GAG T.. .AA TCC ..C A.. ..G ..C ... A.C A.. GAA G.A T.A .AG GAG ... T.T ..G ..C .AC ... Serinus .CT G.A GCA A.T GAG TAC .AA TCC ..C A.. ..G ..C AGC A.C A.. GAG A.A T.A .AA GAG A.. ..T ..G ..C .AC ..A [ 937 1014] Ovis AGC CCG TTG GTC CTA AAG AGA TGC CAC GTG TCT ACG CAT CAG CAC AAT TAC GCA GCG CCC CCC TCC ACT AGG AAG GAC Sus ... ..C C.. ... ..T ... ... ... ..T ... ..C ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..C ... ... ... Canis ... ..A C.. ... ..T ... ... ... ..T ... ..C ..C ... ... ... ..C ... ..G ..A ... ... ... ..C ... ... ... Felis ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... C.C ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Pteropus ... ..A C.. ... ..T ... C.G ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..T ... ..C ... ..A ... Tadarida ... ..A C.. ... ..T ... ... ... ..T ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Cynocephalus ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..C ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Sylvilagus ... ... C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ..C ... ... ... Callithrix ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ... ... ... ..C ..T ... ... ..G C.. ... ... Gorilla ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... Homo ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... Hylobates ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... Pan ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... Pongo ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... Marmota ... ..A C.. ... ..G ... ..G ... ... ..C ..C ..A ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... Mus ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ... ..C ..C ..T ..C ... ... ..C ... ..C ..A ... ... ... ..A ... ... ... Rattus ... ..A C.. ... ..C ... ..G ... ..T ..C ... ..T ..C ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... Tupaia ..T ..A C.. ..T ..C ... ..G ... ..T ..C ..C ..C ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ..C ... ... ... Gallus ..T ... C.. ... ..C ... C.G ..T ... ..C AAC .TC ..C ..A ... ..C ... ..T ..T ..T ... ... ..C .A. GT. ..A Serinus ... ... C.A ..T ..C ..A ..G ..T ..T ..C AAC .TC ... ... ... ... ..T ..T ..T ..T ... ... ..C .A. GTT ..A [ 1015 1092] Ovis TAT CCC GCC GCC AAG AGG GCT AAG TTG GAC AGT GGC AGG GTC CTG AAA CAG ATC AGC AAC AAC CGC AAA TGT GCC AGC Sus ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ... Canis ... ... ... ... ... ... ..G .G. ... ... ... ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Felis ..C ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AT. ... Pteropus ... ... C.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... Tadarida ... ..T C.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... C.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... ... Cynocephalus ... ..G ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ... ..T Sylvilagus ..C ..A ..T ... ... C.. ..C ... ... ... ... ... C.A ... ... ..G ... ... ... ... ..T ... .G. ..C ... ... Callithrix ..C ..A ..T ... ... ... .TC ... ... ... ... .T. ..A ... ... .GG ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ... Gorilla ... ..T ..T ... ... ... .TC ... ... ... ... .T. ..A ... ... .G. ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ... Homo ... ..T ..T ... ... ... .TC ... ... ... ... .T. ..A ... ... .G. ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ... Hylobates ... ..T ..T ... ... ... .TC ... ... ... ... .T. ..A ... ... .G. ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ... Pan ... ..T ..T ... ... ... .TC ... ... ... ... .T. ..A ... ... .G. ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ... Pongo ... ..T ..T ... ... ... .TC ... ... ... ... .T. ..A ... ... .G. ... ... ... ... ... ..A ... ..C A.. ... Marmota .G. ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... Mus ... ..A ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..G ..C T.. ... Rattus ... ..A ..T ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.. ... Tupaia ..C ..A ..T ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... Gallus ..C ..A ... ... ... ... CTA ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C T.. ..T Serinus ..C ..A ..T ..A ..A ... CTA .G. ... ... ... ... ..A ..T ..C ... ... ... ..A .CA .C. GAA ... ..C T.. ..T [ 1093 1170] Ovis CCG AGG TCT --- --- --- TCG GAC ACG GAG GAG AAT GAC AAG AGG CGG ACA CAC AAC GTT TTG GAG CGC CAG AGG AGA Sus ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ..A ... ... ... ... Canis ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G Felis ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... Pteropus ..C ... ..C ... ... ... ..A ... ..A ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... C.. ..A ... ... ... ... Tadarida ..C ... ..C ... ... ... ..C ... T.A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... Cynocephalus ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ..A ... ... Sylvilagus ..C ... ..C ... ... ... ..A ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... Callithrix ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ..A ..G ... ... ..C C.. ..A ... ... ... ..G Gorilla ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G Homo ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... .T. ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G Hylobates ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G Pan ..C ... ..C ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G Pongo ..C ... ..C ... ... ... ... ... G.C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G Marmota ..C ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ... ... ... Mus ..C ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ..T ... ... ..G Rattus ..C ... ..C ... ... ... ..A ... ..C ... ..A ..C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ..T ... ... ... Tupaia ..C ... ..C ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C C.. ..A ... ... ... C.. Gallus ..C C.C A.G ... ... ... ..A ... T.A ... ... ..C ... ... ... ..A ..G ... ... ..C ... ... ... ... C.A ..G Serinus ... C.C A.G TCA GGC TCG ..A ..T T.. ..A ... ..C ... ... ... ..A ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... [ 1171 1248] Ovis AAC GAG CTG AAA CGC AGC TTT TTT GCT CTT CGT GAC CAG ATC CCA GAG TTG GAG AAC AAT GAA AAA GCC CCC AAA GTA Sus ... ... ... ... ... ... ... ... ..C .G. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... Canis ... ... ... ... ..G ... ..C ... ..C ..G ... ..T ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Felis ... ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..G ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ..G ... ... ..G ..G Pteropus ... ... ... ... ... ... ... ..C ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Tadarida ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..G ..C ... ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Cynocephalus ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... Sylvilagus ..T ... ... ... A.G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Callithrix ... ... ..C ... ..G ... ..C ... ..C ..G ... ... ..A ... ... ... C.. ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Gorilla ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Homo ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Hylobates ..T ... ..A ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Pan ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Pongo ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..G ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ..G ... Marmota ..T ... ... ... ..G ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..C ... ..G ... ... ..G ... Mus ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ..T ..A ... ..A ... ..C ... ..G ... ... ..G ... Rattus ... ... ... ..G ..T ... ... ... ..C ..G ..C ... ... ... ..T ... ... ..A ... ..C ... ..G ... ... ..G ... Tupaia ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ..G ... ... ... ... Gallus ..T ... ... ..G .TG ..T ..C ... ..C ..G ... ... ... ..A ..C ... G.. .CC ... ..C ..G ..G ..G ... ..G ..T Serinus ..T ... ... ..G TTG ..T ..C ... ..C T.G ... ... G.A ..A ..C ... G.. .CC ... ... ... ..G ..T ... ..G ..T [ 1249 1326] Ovis GTT ATC CTT AAA AAA GCC ACA GCA TAC ATC CTG TCG GTC CAA GCA GAG GAG CAA AAG CTC ATT TCA GAA AAA GAC GTG Sus ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... G.G ... ... ... ... ... Canis ..G ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... ... ... ... C.. ..C ... ..G ... T.. Felis ..G ... ... ... ..G ... ..C ..G ... ... ... ..C ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... C.. Pteropus ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... G.C A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.A Tadarida ..C ... ... ... ... ... ..C ..G ... ... ... G.C A.. ... ..G ... ... ..G ... ... ... ... ... ..G ... T.A Cynocephalus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ..G ... T.. Sylvilagus ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.C ... ... ..G ... ... ... ... ... G.. ..G ..G ..G ... T.. Callithrix ... ..T ... ..G ... ... ... A.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... T.. Gorilla ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... T.. Homo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... T.. Hylobates ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... .G. ... ... ... ... ... .C. ..T ... ..G ... T.. Pan ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... G.G ... T.. Pongo ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... T.. Marmota A.A ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... T.. Mus ..G ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C A.T ... ... ..C ... ..C ... ... .CC ..T ... ..G ... T.A Rattus ... ... ..C ... ... ... ..C ..C ... ... ... ..C ..T ... ... ..T ... ..C ..A ... ..C ... ... ..G ... T.A Tupaia ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ..T T.. Gallus ..C ... ..G ... ... ... ..G .AG ... G.T ... ..T A.. ... T.G ..C ... ..C .GA ..A ..C G.. ..G ... ..G CA. Serinus ..C ... ..G ... ... ..A ..G .AG ..T G.T ..T ..C A.. ..G T.. ... ..A ..C .GA ..G ... G.. ..G ... ..G CA. [ 1327 1389] Ovis TTG CGG AAG AGG CGA GAA CAG TTG AAA CTC AAA CTT GAA CAG ATA CGG AAC TCT TGC GCC TAA Sus C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... C.A ... Canis ... ... ... C.. ... ... ... ... ... .A. ... ..G ... ... C.. A.. ... ... G.T ... ... Felis ... A.. ... C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. A.. ... ... ..T ..A ... Pteropus ... ... ... C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..A .G. Tadarida ... ..A ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..A ... Cynocephalus ... ... ... C.. ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.G ... ... ... ..T ... ... Sylvilagus ... ... ..A C.. ... ..G ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..A .G. Callithrix ... ... ... C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.G ... ... ... ..T ..A ... Gorilla ... ... ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..G ... Homo ... ... ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..G ... Hylobates ... ... ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..A ... Pan ... ... ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..G ... Pongo ... ... ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..G ... Marmota ... A.. ... C.. ... ... ... ..A ... .AG ... ... ... ... C.G ... ... ... ..T ... ... Mus ... A.. ..A C.A ... ... ... ... ... .A. ... ..C ... ... C.T ..A ... ... G.T ..A ... Rattus C.. A.. ..A C.. ... ... ... ... ... .A. ... ..C ... ... C.T ..A ... ... G.T ..A ... Tupaia ..A A.. ... C.. ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... C.. ... ... ... ..T ..A ... Gallus ... A.. CG. ... A.. ... ... ... ... .A. ... ... ..G ... C.. A.. ... ... C.T ..A ..G Serinus ... A.A CG. ... A.. ... ... ... ... .A. ... ... ..G ... C.. A.. ... .G. ..T ..G .G. ; End;