Data from: The HIV capsid mimics karyopherin engagement of FG-nucleoporins

Jacques, David1 ; Dickson, Claire1 ; Hertel, Sophie1 ; Ruan, Juanfang1 ; Ariotti, Nicholas2 ; Tuckwell, Andrew1 ; Li, Nan1 ; Al-Izzi, Sami3

Published Oct 20, 2023; Updated Jan 09, 2024 on Dryad. https://doi.org/10.5061/dryad.b2rbnzsm0

Cite this dataset

Jacques, David et al. (2024). Data from: The HIV capsid mimics karyopherin engagement of FG-nucleoporins [Dataset]. Dryad. https://doi.org/10.5061/dryad.b2rbnzsm0

Abstract

HIV can infect non-dividing cells because the viral capsid can overcome the selective barrier of the nuclear pore complex and deliver the genome directly into the nucleus. Remarkably, the intact HIV capsid is over one thousand times greater than the size-limit prescribed by the nuclear pore’s diffusion barrier. This barrier is a phase-separated condensate in the central channel of the nuclear pore and is comprised of intrinsically-disordered nucleoporin domains enriched in phenylalanine-glycine (FG) dipeptides. Through multivalent FG-interactions, cellular karyopherins and their bound cargoes solubilise in this phase to drive nucleocytoplasmic transport. By performing an in vitro dissection of the nuclear pore complex, we show that a pocket on the surface of the HIV capsid similarly interacts with FG-motifs from multiple nucleoporins and that this interaction licenses capsids to penetrate nucleoporin condensates. This karyopherin mimicry model resolves a key conceptual challenge for the role of the HIV capsid in nuclear entry, and explains how an exogenous entity much larger than any known cellular cargo can non-destructively breach the nuclear envelope.

README

Fluorescence fluctuation spectroscopy, confocal microscopy, and cryo-elecrtron tomography data from 'The HIV capsid mimics karyopherin engagement of FG-nucleoporins'

Description of the data and file structure

Data archive for 'Data from: The HIV capsid mimics karyopherin engagement of FG-nucleoporins'

by Dickson, C.F., Hertel, S., Ruan, J., Ariotti, N., Tuckwell, A., Li, N., Al-Izzi, S.C., Sierecki, E., Gambin, Y., Morris, R.G., Towers, G.J., Böcking, T., Jacques, D.A.

This dataset contains data and analysis files that should allow the replication of outputs demonstrating that the HIV capsid specifically engages with FG-nucleoporins, and that this interaction enable the virus to penetrate the diffusion barrier of the nuclear pore complex. These results show that the HIV capsid mimics the endogenous nuclear transport receptors (the karyopherin) to gain access to the nucleus, explaining how the virus can infect non-dividing cells.

Data are structured according to the figures in which they are presented in the preprint and publication.

Figure 1 - Fluorescence Fluctuation Spectroscopy data on Nups binding to HIV capsid-like particles
Figure 2 - Fluorescence Fluctuation Spectroscopy data on Nup domains binding to WT and mutant HIV capsid-like particles
Figure 3 - Confocal microscopy data of Nup98 phase condensates binding to various HIV capsid assemblies. Also includes Fluorescence Fluctuation Spectroscopy data on karyopherin interactions with HIV capsid-like particles.
Figure 4 - Cryo-electron tomography data on Nup98 condensates with and without incorporated HIV capsid-like particles
Figure 4 Additional - Cryo-electron tomography data on Nup98 condensates with incorporated HIV (N57D) mutant capsid-like particles

Summary of files
For dir titled FFS Data:
Experimental details are outlined in the methods section as well as in Lau et al 2021 (PMID: 33593049)
Several sub directories titled with the experimental condition. Within each raw data is contained several extentionless data files (tab delimitated) representing each confocal trace. These files contain two columns, the first and second columns represent coupled fluorescent emission intensities from 1 ms exposures in the confocal volume for Channel 1 (568 nm) and Channel 2 (488 nm), respectively (arbitrary units).
Within this directory is also an Analysis sub-directory
The Analysis directory contains the output of in-house analysis software TRISTIANhttps://github.com/lilbutsa/Tristan. This output is comprised of several output files named with the prefix of the name of the containing condition directory (3). These files are as follows:

_Raw_Traces.eps and _ Raw_Traces.png: Mirror plots of intensities for each trace with channel 2 (488 nm) on top and channel 1 (568 nm) on the bottom.
_Scaled_Traces.eps and _ Scaled _Traces.png: Mirror plots as for raw but scaled by std dev of whole trace
A directory entitled Filtered_Data
This Filtered_Data directory contains .csv files representing the Filtered_Raw_Traces in the containing directory as well as, a Combined_Data.csv file with each filtered trace concatenated in order.
_Filtered_Raw_Traces.eps and _Filtered_Raw_Traces.png: Mirror plots as for Raw_Traces but with data points >10,000 in channel 2 removed from both channels.
_Nup98_Filtered_Scaled_Traces.png: Mirror plots as for filtered but scaled by std dev of filtered traces.
_Density_Plots.eps and _Density_Plots.png: Heatmap representation of correlation between channel 1 (568 nm, x axis) and channel 2 (488 nm y-axis) intensities for each point for each file in the Filtered_Data directory.
_Pooled_Density_Plot.eps and _Pooled_Density_Plot.png: Heatmap representation of correlation between channel 1 (568 nm, x axis) and channel 2 (488 nm y-axis) intensities for each point for the Combined_Data.csv file in the Filtered_Data directory.
dir.fig and dir.png: Pooled_Density_Plot with x- and y-axis ranges defined by TRISTAN as MATLAB figure and png format.
Correlation_Summary.csv file containing tabulated information and statistics for each of the Filtered_Raw_Traces in the Filtered_Data directory. Column headings are as follows:
Row: Numbered data identifying trace
Ch1_Mode: Mode of 568 nm channel trace
Ch2_Mode: Mode of 488 nm channel trace
Offset: y-offset value from fitting correlation of 568 nm vs 488 nm
Gradient:Gradient from fitting correlation of 568 nm vs 488 nm
Offset_Mode_Constrained: y-offset value from fitting correlation of 568 nm vs 488 nm when fit is constrained to pass through the intersection of the mode from both channels.
Gradient_Mode_Constrained: Gradient from fitting correlation of 568 vs 488 nm when fit is constrained to pass through the intersection of the mode from both channels.
Ch1_Mean: Mean of 568 nm channel trace data.
Ch2_Mean: Mean of 488 nm channel trace data.
Ch1_Std_Dev: Standard deviation of 568 nm channel trace data.
Ch2_Std_Dev: Standard deviation of 488 nm channel trace data.
Ch1_Median: Median deviation of 568 nm channel trace data.
Ch2_Median: Median deviation of 488 nm channel trace data.
Ch1_B_value: Square of Ch1_Std_Dev divided by Ch1_Mean.
Ch2_B_value: Square of Ch2_Std_Dev divided by Ch2_Mean.
For dir titled confocal_microscopy
Raw data are provided in the Zeiss fluorescent microscopy format .czi (can be opened with open-source software ImageJ)
radially averaged profiles are proved as .csv files

For dir titled CryoEM data
Raw data are provided in the common electronmicrograph formats .mrc and .mdoc

Schema of data archive
Dataset
├── Figure 1
│   └── FFS Data
│   ├── CA_300421
│   │   ├── CA_Analysis
│   │   │   ├── CA_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── CA_Raw_Traces.png
│   │   │   └── Filtered_Data
│   │   ├── HIV1CA_lesslabel
│   │   ├── HIV1CA_lesslabel_02
│   │   ├── HIV1CA_lesslabel_03
│   │   ├── HIV1CA_lesslabel_04
│   │   └── HIV1CA_lesslabel_05
│   ├── CPSF6-FL+CA
│   │   ├── CPSF6-FL+CA
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_02
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_03
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_04
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_05
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_Analysis
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA.fig
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA.svg
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Channel_Alignment.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Density_Plots.png
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   └── Filtered_Data
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_02_Filtered.csv
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_03_Filtered.csv
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_04_Filtered.csv
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_05_Filtered.csv
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_Filtered.csv
│   │   │   ├── CPSF6-FL+CA_repeat_02_Filtered.csv
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│   │   │   └── CPSF6-FL+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_repeat
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_repeat_02
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_repeat_03
│   │   ├── CPSF6-FL+CA_repeat_04
│   │   └── CPSF6-FL+CA_repeat_05
│   ├── CypA+CA
│   │   ├── CypA+CA
│   │   ├── CypA+CA_02
│   │   ├── CypA+CA_03
│   │   ├── CypA+CA_04
│   │   ├── CypA+CA_05
│   │   ├── CypA+CA_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── CypA+CA.fig
│   │   │   ├── CypA+CA.svg
│   │   │   ├── CypA+CA_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── CypA+CA_Density_Plots.png
│   │   │   ├── CypA+CA_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── CypA+CA_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── CypA+CA_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── CypA+CA_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── CypA+CA_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── CypA+CA_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── CypA+CA_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── CypA+CA_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── CypA+CA_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── CypA+CA_Scaled_Traces.png
│   │   │   └── Filtered_Data
│   │   │   ├── CypA+CA_02_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_03_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_04_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_05_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_repeat_02_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_repeat_03_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   ├── CypA+CA_repeat_05_Filtered.csv
│   │   │   └── CypA+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   ├── CypA+CA_repeat
│   │   ├── CypA+CA_repeat_02
│   │   ├── CypA+CA_repeat_03
│   │   ├── CypA+CA_repeat_04
│   │   └── CypA+CA_repeat_05
│   ├── Nup133
│   │   ├── Nup133
│   │   ├── Nup133_02
│   │   ├── Nup133_03
│   │   ├── Nup133_04
│   │   ├── Nup133_05
│   │   └── Nup133_Analysis
│   │   ├── Filtered_Data
│   │   ├── Nup133_Raw_Traces.eps
│   │   └── Nup133_Raw_Traces.png
│   ├── Nup133+CA
│   │   ├── Nup133+CA
│   │   ├── Nup133+CA_02
│   │   ├── Nup133+CA_03
│   │   ├── Nup133+CA_04
│   │   ├── Nup133+CA_05
│   │   ├── Nup133+CA_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_repeat2_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_repeat2_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_repeat2_04_Filtered.csv
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│   │   │   │   ├── Nup133+CA_repeat_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup133+CA_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   │   └── Nup133+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── Nup133+CA.fig
│   │   │   ├── Nup133+CA.svg
│   │   │   ├── Nup133+CA_Channel_Alignment.eps
│   │   │   ├── Nup133+CA_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── Nup133+CA_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── Nup133+CA_Density_Plots.png
│   │   │   ├── Nup133+CA_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── Nup133+CA_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── Nup133+CA_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── Nup133+CA_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── Nup133+CA_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── Nup133+CA_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── Nup133+CA_Raw_Traces.eps
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│   │   │   ├── Nup133+CA_Scaled_Traces.eps
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│   │   ├── Nup133+CA_repeat
│   │   ├── Nup133+CA_repeat2
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│   │   ├── Nup133+CA_repeat2_04
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│   ├── Nup153
│   │   ├── Nup153
│   │   ├── Nup153_02
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│   │   ├── Nup153_04
│   │   ├── Nup153_05
│   │   ├── Nup153_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── Nup153_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_repeat2_02_Filtered.csv
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│   │   │   │   ├── Nup153_repeat2_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_repeat2_05_Filtered.csv
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│   │   │   │   ├── Nup153_repeat_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_repeat_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153_repeat_05_Filtered.csv
│   │   │   │   └── Nup153_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── Nup153_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── Nup153_Density_Plots.png
│   │   │   ├── Nup153_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── Nup153_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── Nup153_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── Nup153_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── Nup153_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── Nup153_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── Nup153_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── Nup153_Scaled_Traces.eps
│   │   │   └── Nup153_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Nup153_repeat
│   │   ├── Nup153_repeat2
│   │   ├── Nup153_repeat2_02
│   │   ├── Nup153_repeat2_03
│   │   ├── Nup153_repeat2_04
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│   │   ├── Nup153_repeat_02
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│   │   ├── Nup153_repeat_04
│   │   └── Nup153_repeat_05
│   ├── Nup153+CA
│   │   ├── Nup153+CA
│   │   ├── Nup153+CA_02
│   │   ├── Nup153+CA_03
│   │   ├── Nup153+CA_04
│   │   ├── Nup153+CA_05
│   │   ├── Nup153+CA_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── Nup153+CA_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153+CA_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153+CA_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153+CA_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── Nup153+CA_Filtered.csv
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│   │   │   │   └── Nup153+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── Nup153+CA.fig
│   │   │   ├── Nup153+CA.svg
│   │   │   ├── Nup153+CA_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── Nup153+CA_Density_Plots.png
│   │   │   ├── Nup153+CA_Filtered_Raw_Traces.eps
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│   │   │   ├── Nup153+CA_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── Nup153+CA_Pooled_Density_Plot.eps
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│   │   ├── Nup153+CA_repeat
│   │   ├── Nup153+CA_repeat2
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│   │   ├── Nup153+CA_repeat2_03
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│   │   ├── Nup153+CA_repeat_04
│   │   └── Nup153+CA_repeat_05
│   ├── Nup214_1210-2090
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_03
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_05
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat_02
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat_03
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat_04
│   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat_05
│   │   └── Nup214_1210-2090_temp_Analysis
│   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Repeat_1.csv
│   │   │   ├── Repeat_2.csv
│   │   │   ├── Repeat_3.csv
│   │   │   ├── Repeat_4.csv
│   │   │   ├── Repeat_5.csv
│   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   └── Repeat_7.csv
│   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Channel_Alignment.png
│   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Density_Plots.eps
│   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Density_Plots.png
│   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Filtered_Raw_Traces.png
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│   │   │   ├── Nup88+CA.fig
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│   │   ├── Nup98+CA
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│   ├── P121+CA
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│   ├── Pom121+CA.fig
│   ├── Pom121+CA.svg
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├── Figure 1.zip
├── Figure 2
│   └── FFS Data
│   ├── Fig2I
│   │   ├── Nup214-1-450_100221
│   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp
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│   │   │   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
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│   │   │   │   │   └── Nup214_1-450+CA.tif
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│   │   │   └── Nup214_1-450
│   │   │   ├── Nup214_1-450_Analysis
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│   │   ├── Nup214-1210-2090_100221
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp
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│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA.fig
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│   │   │   └── Nup214_1210-2090_temp
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_03
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│   │   │   └── Nup214_1210-2090_temp_Analysis
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
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│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Channel_Alignment.png
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│   │   ├── Nup214_451-1209_10022021
│   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA
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│   │   │   │   └── Filtered_Data
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│   │   │   ├── CypA+N57D_02
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│   │   │   │   └── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
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│   │   └── CypA_alone
│   │   ├── CypA
│   │   ├── CypA.fig
│   │   ├── CypA.png
│   │   ├── CypA_02
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│   │   ├── CypA_alone_Analysis
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│   │   ├── CypA_repeat
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│   │   │   │   ├── Nup152_17_alone_Pooled_Density_Plot.png
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│   │   │   ├── Nup153_17.png
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│   │   │   ├── Nup153_17+A77V
│   │   │   ├── Nup153_17+A77V.fig
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│   │   │   │   └── Nup153_17+CA_Scaled_Traces.png
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│   │   │   ├── Nup153_17+N57D
│   │   │   ├── Nup153_17+N57D.fig
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│   │   │   ├── Nup98+N74D_Filtered_Scaled_Traces.png
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│   ├── Pom121+A77V
│   │   ├── Pom121+A77V
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│   ├── Pom121+CA
│   │   ├── Pom121+CA
│   │   ├── Pom121+CA.fig
│   │   ├── Pom121+CA.tif
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│   │   ├── Pom121+CA_04
│   │   ├── Pom121+CA_05
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│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
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│   │   │   │   ├── Repeat_4.csv
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│   │   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_7.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_8.csv
│   │   │   │   └── Repeat_9.csv
│   │   │   ├── Pom121+CA_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   ├── Pom121+CA_Density_Plots.png
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│   │   │   ├── Pom121+CA_Filtered_Raw_Traces.png
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│   ├── Pom121+N57D
│   │   ├── Pom121+N57D
│   │   ├── Pom121+N57D.fig
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│   │   ├── Pom121+N57D_02
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│   │   ├── Pom121+N57D_Analysis
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
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│   │   │   │   ├── Repeat_7.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_8.csv
│   │   │   │   └── Repeat_9.csv
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   ├── Pom121+N57D_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Raw_Traces.png
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│   │   │   └── Pom121+N57D_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N57D_repeat
│   │   ├── Pom121+N57D_repeat_02
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│   └── Pom121+N74D
│   ├── Pom121+N74D
│   ├── Pom121+N74D.fig
│   ├── Pom121+N74D.tif
│   ├── Pom121+N74D_02
│   ├── Pom121+N74D_03
│   ├── Pom121+N74D_04
│   ├── Pom121+N74D_05
│   ├── Pom121+N74D_Analysis
│   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Repeat_1.csv
│   │   │   ├── Repeat_10.csv
│   │   │   ├── Repeat_2.csv
│   │   │   ├── Repeat_3.csv
│   │   │   ├── Repeat_4.csv
│   │   │   ├── Repeat_5.csv
│   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   ├── Repeat_7.csv
│   │   │   ├── Repeat_8.csv
│   │   │   └── Repeat_9.csv
│   │   ├── Pom121+N74D_Channel_Alignment.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Density_Plots.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Density_Plots.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Pooled_Density_Plot.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Raw_Traces.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Raw_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Scaled_Traces.eps
│   │   └── Pom121+N74D_Scaled_Traces.png
│   ├── Pom121+N74D_repeat
│   ├── Pom121+N74D_repeat_02
│   ├── Pom121+N74D_repeat_03
│   ├── Pom121+N74D_repeat_04
│   └── Pom121+N74D_repeat_05
├── Figure 2.zip
├── Figure 3
│   ├── Confocal Microscopy
│   │   ├── Figure_3
│   │   │   ├── 220803_Aligned_Radial_Averages_All_2.pzfx
│   │   │   ├── CA_hex
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_3.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_4.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_5.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_6.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_7.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_8.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_wt_hex_9.czi
│   │   │   ├── CA_hex_N57A
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_10.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_3.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_4.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_5.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_6.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_7.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_8.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_N57A_hex_9.czi
│   │   │   ├── CA_mon
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_45uM.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_45uM_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_45uM_3.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_monomer_45uM_4.czi
│   │   │   ├── CA_mon_N57A
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_3.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_4.czi
│   │   │   ├── IBBmCherry
│   │   │   │   ├── Nup98_IBBmCherry_200uM_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_IBBmCherry_200uM_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_IBBmCherry_200uM_3.czi
│   │   │   │   └── Nup98_IBBmCherry_200uM_4.czi
│   │   │   └── Impb_IBBmCherry
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_1.czi
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_2.czi
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_3.czi
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_4.czi
│   │   │   └── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_5.czi
│   │   ├── Figure_3_CPSF6
│   │   │   └── CA_CPSF6
│   │   │   ├── 221007_Aligned_Radial_Averages_CPSF6.pzfx
│   │   │   ├── 221107_Aligned_Radial_Averages_N74D_CPSF6_MQW.pzfx
│   │   │   ├── CA_N74D_hex
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_4.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_4.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_low_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_4.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_4.czi
│   │   │   │   └── Values
│   │   │   │   ├── Values_CA_N74D_hex_CPSF6_500_preincubated
│   │   │   │   │   ├── Values_10_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_10_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_11_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_11_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_12_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_12_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_13_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_13_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_14_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_14_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_15_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_15_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_16_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_16_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_17_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_17_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_18_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_18_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_19_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_19_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_1_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_1_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_20_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_20_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_21_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_21_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_22_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_22_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_23_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_23_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_2_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_2_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_3_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_3_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_4_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_4_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_5_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_5_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_6_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_6_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_7_488.csv
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│   │   │   └── Values
│   │   │   ├── CA_CPSF6_preincubated
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│   │   │   ├── Values_51_568.csv
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│   │   │   ├── Values_9_488.csv
│   │   │   └── Values_9_568.csv
│   │   ├── Figure_3_Sup1
│   │   │   ├── Impb_mCherry
│   │   │   │   ├── Nup98_Impb_mCherry_100uM_both_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_Impb_mCherry_100uM_both_2.czi
│   │   │   │   └── Nup98_Impb_mCherry_100uM_both_3.czi
│   │   │   └── mCherry
│   │   │   ├── Nup98_mCherry_45uM_1.czi
│   │   │   ├── Nup98_mCherry_45uM_2.czi
│   │   │   ├── Nup98_mCherry_45uM_3.czi
│   │   │   └── Nup98_mCherry_45uM_4.czi
│   │   └── Figure_3_Sup_NTF
│   │   ├── 220914_NTF.pzfx
│   │   ├── CA_hex_25uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_hex_25uM_5min.czi
│   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_5min.czi
│   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM_5min.czi
│   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_5min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_mon_25uM_5min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_mon_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_5min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO1_2p5uM
│   │   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO1_2p5uM_10min.czi
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│   │   │   └── CA_mon_25uM_TNPO1_2p5uM_5min.czi
│   │   └── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_10min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_11min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_12min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_3min.czi
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_4min.czi
│   │   └── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_5min.czi
│   └── FFS Data
│   ├── ImpA
│   │   ├── ImpA
│   │   ├── ImpA_02
│   │   ├── ImpA_03
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│   │   ├── ImpA_repeat_02
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│   │   ├── ImpA_repeat_04
│   │   └── ImpA_repeat_05
│   ├── ImpA+CA
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│   │   ├── ImpA+CA.tif
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│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── ImpA+CA_02_Filtered.csv
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│   │   │   │   ├── ImpA+CA_repeat_02_Filtered.csv
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│   │   │   ├── ImpA+CA_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   ├── ImpA+CA_Density_Plots.png
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│   │   │   ├── ImpA+CA_Pooled_Density_Plot.png
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│   │   │   └── ImpA+CA_Scaled_Traces.png
│   │   ├── ImpA+CA_repeat
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│   ├── TNPO1
│   │   ├── TNPO1
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│   │   ├── TNPO1_repeat
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│   ├── TNPO1+CA
│   │   ├── TNPO1+CA
│   │   ├── TNPO1+CA_02
│   │   ├── TNPO1+CA_03
│   │   ├── TNPO1+CA_04
│   │   ├── TNPO1+CA_05
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│   │   │   ├── Combined_Data.csv
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│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA_02_Filtered.csv
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│   │   │   │   └── TNPO1+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO1+CA.fig
│   │   │   ├── TNPO1+CA.tif
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│   │   ├── TNPO1+CA_repeat
│   │   ├── TNPO1+CA_repeat2
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│   │   ├── TNPO1+CA_repeat_02
│   │   ├── TNPO1+CA_repeat_03
│   │   ├── TNPO1+CA_repeat_04
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│   ├── TNPO1+CA+TNPO1
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_02
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_03
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_04
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_05
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
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│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered.csv
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│   │   │   │   └── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1.fig
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│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Pooled_Density_Plot.png
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│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Scaled_Traces.eps
│   │   │   └── TNPO1+CA+TNPO1_Scaled_Traces.png
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_02
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│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_02
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_03
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_04
│   │   └── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_05
│   ├── TNPO3
│   │   ├── TNPO3
│   │   ├── TNPO3_02
│   │   ├── TNPO3_03
│   │   ├── TNPO3_04
│   │   └── TNPO3_05
│   ├── TNPO3+CA
│   │   ├── TNPO3+CA
│   │   ├── TNPO3+CA_02
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│   │   ├── TNPO3+CA_04
│   │   ├── TNPO3+CA_05
│   │   ├── TNPO3+CA_Analysis
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│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_03_Filtered.csv
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│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_05_Filtered.csv
│   │   │   │   └── TNPO3+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA.fig
│   │   │   ├── TNPO3+CA.tif
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   ├── TNPO3+CA_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Raw_Traces.eps
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│   │   │   ├── TNPO3+CA_Scaled_Traces.eps
│   │   │   └── TNPO3+CA_Scaled_Traces.png
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_02
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_03
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_04
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_05
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat_02
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat_03
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat_04
│   │   └── TNPO3+CA_repeat_05
│   └── TNPO3+CA+TNPO3
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_02
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_03
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_04
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_05
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Analysis
│   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_02_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_03_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_04_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_05_Filtered.csv
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│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_02_Filtered.csv
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│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_03_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_05_Filtered.csv
│   │   │   └── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_Filtered.csv
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3.fig
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3.tif
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Channel_Alignment.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Channel_Alignment.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Density_Plots.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Density_Plots.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Pooled_Density_Plot.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Raw_Traces.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Raw_Traces.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Scaled_Traces.eps
│   │   └── TNPO3+CA+TNPO3_Scaled_Traces.png
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_02
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_03
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_04
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_05
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_02
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_03
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_04
│   └── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_05
├── Figure 3.zip
├── Figure 4
│   ├── Confocal Microscopy
│   │   └── Figure_4
│   │   ├── Nup98_CA_N57A_1.czi
│   │   ├── Nup98_CA_N57A_2.czi
│   │   ├── Nup98_CA_N57A_3.czi
│   │   ├── Nup98_CAwt_1.czi
│   │   ├── Nup98_CAwt_2.czi
│   │   └── Nup98_CAwt_3.czi
│   └── CryoEM data
│   ├── Raw-tilts
│   │   ├── Nup98
│   │   │   ├── nup_15.mdoc
│   │   │   ├── nup_15.mrc
│   │   │   ├── nup_2.mdoc
│   │   │   ├── nup_2.mrc
│   │   │   ├── nup_50.mdoc
│   │   │   ├── nup_50.mrc
│   │   │   ├── nup_51.mdoc
│   │   │   ├── nup_51.mrc
│   │   │   ├── nup_6.mdoc
│   │   │   └── nup_6.mrc
│   │   └── Nup98+CA
│   │   ├── CA_1.mdoc
│   │   ├── CA_1.mrc
│   │   ├── CA_18.mdoc
│   │   ├── CA_18.mrc
│   │   ├── CA_22.mdoc
│   │   ├── CA_22.mrc
│   │   ├── CA_27.mdoc
│   │   ├── CA_27.mrc
│   │   ├── CA_46.mdoc
│   │   ├── CA_46.mrc
│   │   ├── CA_48.mdoc
│   │   ├── CA_48.mrc
│   │   ├── CA_5.mdoc
│   │   ├── CA_5.mrc
│   │   ├── CA_53.mdoc
│   │   ├── CA_53.mrc
│   │   ├── CA_62.mdoc
│   │   └── CA_62.mrc
│   └── Tomograms
│   ├── Nup98
│   │   ├── nup_15_rec.mrc
│   │   ├── nup_2_rec.mrc
│   │   ├── nup_50_rec.mrc
│   │   ├── nup_51_rec.mrc
│   │   └── nup_6_rec.mrc
│   └── Nup98+CA
│   ├── CA_18_rec.mrc
│   ├── CA_1_rec.mrc
│   ├── CA_22_rec.mrc
│   ├── CA_27_rec.mrc
│   ├── CA_46_rec.mrc
│   ├── CA_48_rec.mrc
│   ├── CA_53_rec.mrc
│   ├── CA_5_rec.mrc
│   └── CA_62_rec.mrc
├── Figure 4 Additional
│   └── CryoEM data N74D
│   ├── Raw-tilts
│   │   ├── N57D_1.mrc
│   │   ├── N57D_11.mrc
│   │   └── N57D_3.mrc
│   └── Tomograms
│   ├── N57D_11_rec.mrc
│   ├── N57D_1_rec.mrc
│   └── N57D_3_rec.mrc
├── Figure 4 Additional.zip
├── Figure 4.zip
└── Missing_Data
├── Extended-Data-Figure11
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_02
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_03
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_04
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_05
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_05_Filtered.csv
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└── Figure2b-i
├── Nup58_27112020
│   ├── Nup58+A77V
│   │   ├── Nup58+A77V
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│   │   ├── Nup58+A77V.tif
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460 directories, 5051 files
192-168-1-118:Dataset DavidJacques$ cd Directories/
192-168-1-118:Directories DavidJacques$ ls
Figure 1 Figure 2 Figure 3 Figure 4 Figure 4 Additional
192-168-1-118:Directories DavidJacques$ tree
.
├── Figure 1
│   └── FFS Data
│   ├── CA_300421
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│   ├── P121+CA_repeat2_02
│   ├── P121+CA_repeat2_03
│   ├── P121+CA_repeat2_04
│   ├── P121+CA_repeat2_05
│   ├── P121+CA_repeat_02
│   ├── P121+CA_repeat_03
│   ├── P121+CA_repeat_04
│   └── Pom121+CA_Analysis
│   ├── Combined_Data.csv
│   ├── Correlation_Summary.csv
│   ├── Filtered_Data
│   │   ├── P121+CA_02_Filtered.csv
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│   │   ├── P121+CA_Filtered.csv
│   │   ├── P121+CA_repeat2_02_Filtered.csv
│   │   ├── P121+CA_repeat2_03_Filtered.csv
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│   │   ├── P121+CA_repeat2_Filtered.csv
│   │   ├── P121+CA_repeat_02_Filtered.csv
│   │   ├── P121+CA_repeat_03_Filtered.csv
│   │   ├── P121+CA_repeat_04_Filtered.csv
│   │   └── P121+CA_repeat_Filtered.csv
│   ├── Pom121+CA.fig
│   ├── Pom121+CA.svg
│   ├── Pom121+CA_Density_Plots.eps
│   ├── Pom121+CA_Density_Plots.png
│   ├── Pom121+CA_Filtered_Raw_Traces.eps
│   ├── Pom121+CA_Filtered_Raw_Traces.png
│   ├── Pom121+CA_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   ├── Pom121+CA_Filtered_Scaled_Traces.png
│   ├── Pom121+CA_Pooled_Density_Plot.eps
│   ├── Pom121+CA_Pooled_Density_Plot.png
│   ├── Pom121+CA_Raw_Traces.eps
│   ├── Pom121+CA_Raw_Traces.png
│   ├── Pom121+CA_Scaled_Traces.eps
│   └── Pom121+CA_Scaled_Traces.png
├── Figure 2
│   └── FFS Data
│   ├── Fig2I
│   │   ├── Nup214-1-450_100221
│   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp
│   │   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp_Analysis
│   │   │   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   │   │   │   ├── Repeat_1.csv
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│   │   │   │   │   │   ├── Repeat_3.csv
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│   │   │   │   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   │   │   │   └── Repeat_7.csv
│   │   │   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp_Channel_Alignment.eps
│   │   │   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp_Channel_Alignment.png
│   │   │   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp_Density_Plots.eps
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│   │   │   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp_Pooled_Density_Plot.eps
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│   │   │   │   │   ├── Nup213_1-450+CA_temp_Raw_Traces.eps
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│   │   │   │   │   ├── Nup214_1-450+CA.fig
│   │   │   │   │   └── Nup214_1-450+CA.tif
│   │   │   │   ├── Nup214_1-450+CA_02
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│   │   │   │   ├── Nup214_1-450+CA_repeat2_03
│   │   │   │   ├── Nup214_1-450+CA_repeat_02
│   │   │   │   └── Nup214_1-450+CA_repeat_03
│   │   │   └── Nup214_1-450
│   │   │   ├── Nup214_1-450_Analysis
│   │   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   │   │   ├── Repeat_1.csv
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│   │   │   │   ├── Nup214_1-450_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   │   ├── Nup214_1-450_Density_Plots.eps
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│   │   │   ├── Nup214_1-450_alone_05
│   │   │   ├── Nup214_1-450_alone_repeat_02
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│   │   │   └── Nup214_1-450_alone_repeat_05
│   │   ├── Nup214-1210-2090_100221
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_02
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│   │   │   │   └── Nup214_1210-2090+CA_temp_Analysis
│   │   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
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│   │   │   │   │   └── Repeat_8.csv
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA.fig
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA.tif
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Channel_Alignment.eps
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Channel_Alignment.png
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Density_Plots.eps
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Density_Plots.png
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│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Filtered_Scaled_Traces.eps
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│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Raw_Traces.eps
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Raw_Traces.png
│   │   │   │   ├── Nup214_1210-2090+CA_temp_Scaled_Traces.eps
│   │   │   │   └── Nup214_1210-2090+CA_temp_Scaled_Traces.png
│   │   │   └── Nup214_1210-2090_temp
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_03
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_05
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│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat_02
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│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_alone_repeat_05
│   │   │   └── Nup214_1210-2090_temp_Analysis
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_1.csv
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│   │   │   │   ├── Repeat_4.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_5.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   │   └── Repeat_7.csv
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── Nup214_1210-2090_temp_Density_Plots.eps
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│   │   │   └── Nup214_1210-2090_temp_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Nup214_451-1209_10022021
│   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_02
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_03
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_04
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│   │   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
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│   │   │   │   │   │   └── Nup214_451-1209+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA.fig
│   │   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA.tif
│   │   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_Raw_Traces.eps
│   │   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_Raw_Traces.png
│   │   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_Scaled_Traces.eps
│   │   │   │   │   └── Nup214_451-1209+CA_Scaled_Traces.png
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_repeat
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_repeat_02
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_repeat_03
│   │   │   │   ├── Nup214_451-1209+CA_repeat_04
│   │   │   │   └── Nup214_451-1209+CA_repeat_05
│   │   │   └── Nup214_451-1209_alone
│   │   │   ├── Nup214_451-1209_alone_05
│   │   │   ├── Nup214_451-1209_alone_repeat_02
│   │   │   ├── Nup214_451-1209_alone_repeat_03
│   │   │   ├── Nup214_451-1209_alone_repeat_04
│   │   │   ├── Nup214_451-1209_alone_repeat_05
│   │   │   └── temp_Analysis
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_1.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_2.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_3.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_4.csv
│   │   │   │   └── Repeat_5.csv
│   │   │   ├── temp_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── temp_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── temp_Density_Plots.png
│   │   │   ├── temp_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── temp_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── temp_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── temp_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── temp_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── temp_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── temp_Raw_Traces.png
│   │   │   └── temp_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Nup98-1-499_30042021
│   │   │   ├── Nup98_1-499
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_02
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_03
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_04
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_05
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_Analysis
│   │   │   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   │   ├── Nup98_1-499_Raw_Traces.eps
│   │   │   │   │   └── Nup98_1-499_Raw_Traces.png
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_repeat
│   │   │   │   ├── Nup98_1-499_repeat_02
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│   │   │   │   └── Nup98_1-499_repeat_05
│   │   │   └── Nup98_1-499+CA
│   │   │   ├── Nup98_1-499+CA
│   │   │   ├── Nup98_1-499+CA_02
│   │   │   ├── Nup98_1-499+CA_03
│   │   │   ├── Nup98_1-499+CA_04
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│   │   │   ├── Nup98_1-499+CA_Analysis
│   │   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
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│   │   ├── Pom121-2+CA+1pDMSO
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│   ├── Fig2J
│   │   ├── Nup98-342-356-02062021
│   │   │   ├── AF488-Nup98GLFG
│   │   │   │   ├── AF488-Nup98GLFG
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│   │   │   │   ├── Nup98-GLFG+CA
│   │   │   │   ├── Nup98-GLFG+CA_02
│   │   │   │   ├── Nup98-GLFG+CA_03
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│   │   │   │   ├── Nup98-GLFG+N57D
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│   └── Fig2b-g
│   ├── CPSF6_15-27112020
│   │   ├── CPSF6_15+A77V
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│   │   │   ├── CPSF6_15+CA_repeat
│   │   │   ├── CPSF6_15+CA_repeat_02
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│   │   │   ├── CPSF6_15+CA_temp_Channel_Alignment.eps
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│   │   │   ├── CypA+N57D_repeat
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│   │   │   ├── Filtered_Data
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│   │   │   │   ├── Repeat_1.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_10.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_2.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_3.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_4.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_5.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_7.csv
│   │   │   │   ├── Repeat_8.csv
│   │   │   │   └── Repeat_9.csv
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Channel_Alignment.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Density_Plots.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── Pom121+N57D_Scaled_Traces.eps
│   │   │   └── Pom121+N57D_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N57D_repeat
│   │   ├── Pom121+N57D_repeat_02
│   │   ├── Pom121+N57D_repeat_03
│   │   ├── Pom121+N57D_repeat_04
│   │   └── Pom121+N57D_repeat_05
│   └── Pom121+N74D
│   ├── Pom121+N74D
│   ├── Pom121+N74D.fig
│   ├── Pom121+N74D.tif
│   ├── Pom121+N74D_02
│   ├── Pom121+N74D_03
│   ├── Pom121+N74D_04
│   ├── Pom121+N74D_05
│   ├── Pom121+N74D_Analysis
│   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Repeat_1.csv
│   │   │   ├── Repeat_10.csv
│   │   │   ├── Repeat_2.csv
│   │   │   ├── Repeat_3.csv
│   │   │   ├── Repeat_4.csv
│   │   │   ├── Repeat_5.csv
│   │   │   ├── Repeat_6.csv
│   │   │   ├── Repeat_7.csv
│   │   │   ├── Repeat_8.csv
│   │   │   └── Repeat_9.csv
│   │   ├── Pom121+N74D_Channel_Alignment.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Density_Plots.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Density_Plots.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Pooled_Density_Plot.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Raw_Traces.eps
│   │   ├── Pom121+N74D_Raw_Traces.png
│   │   ├── Pom121+N74D_Scaled_Traces.eps
│   │   └── Pom121+N74D_Scaled_Traces.png
│   ├── Pom121+N74D_repeat
│   ├── Pom121+N74D_repeat_02
│   ├── Pom121+N74D_repeat_03
│   ├── Pom121+N74D_repeat_04
│   └── Pom121+N74D_repeat_05
├── Figure 3
│   ├── Confocal Microscopy
│   │   ├── Figure_3
│   │   │   ├── 220803_Aligned_Radial_Averages_All_2.pzfx
│   │   │   ├── CA_hex
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_3.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_4.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_5.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_6.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_7.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_wt_hex_8.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_wt_hex_9.czi
│   │   │   ├── CA_hex_N57A
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_10.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_3.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_4.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_5.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_6.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_7.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_N57A_hex_8.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_N57A_hex_9.czi
│   │   │   ├── CA_mon
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_45uM.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_45uM_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_45uM_3.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_monomer_45uM_4.czi
│   │   │   ├── CA_mon_N57A
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_3.czi
│   │   │   │   └── Nup98_CA_monomer_N57A_45uM_4.czi
│   │   │   ├── IBBmCherry
│   │   │   │   ├── Nup98_IBBmCherry_200uM_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_IBBmCherry_200uM_2.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_IBBmCherry_200uM_3.czi
│   │   │   │   └── Nup98_IBBmCherry_200uM_4.czi
│   │   │   └── Impb_IBBmCherry
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_1.czi
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_2.czi
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_3.czi
│   │   │   ├── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_4.czi
│   │   │   └── Nup98_Impb_IBBmCherry_60uM_5.czi
│   │   ├── Figure_3_CPSF6
│   │   │   └── CA_CPSF6
│   │   │   ├── 221007_Aligned_Radial_Averages_CPSF6.pzfx
│   │   │   ├── 221107_Aligned_Radial_Averages_N74D_CPSF6_MQW.pzfx
│   │   │   ├── CA_N74D_hex
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_high_4.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_20min_low_4.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_CPSF6_500_preincubated_low_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_high_4.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_N74D_MQW_noCPSF6_low_4.czi
│   │   │   │   └── Values
│   │   │   │   ├── Values_CA_N74D_hex_CPSF6_500_preincubated
│   │   │   │   │   ├── Values_10_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_10_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_11_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_11_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_12_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_12_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_13_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_13_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_14_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_14_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_15_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_15_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_16_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_16_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_17_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_17_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_18_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_18_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_19_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_19_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_1_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_1_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_20_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_20_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_21_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_21_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_22_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_22_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_23_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_23_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_2_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_2_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_3_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_3_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_4_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_4_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_5_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_5_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_6_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_6_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_7_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_7_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_8_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_8_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_9_488.csv
│   │   │   │   │   └── Values_9_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_CA_N74D_hex_CPSF6_post_20min
│   │   │   │   │   ├── Values_10_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_10_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_11_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_11_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_12_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_12_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_13_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_13_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_14_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_14_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_15_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_15_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_16_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_16_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_17_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_17_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_18_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_18_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_19_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_19_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_1_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_1_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_20_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_20_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_2_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_2_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_3_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_3_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_4_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_4_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_5_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_5_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_6_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_6_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_7_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_7_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_8_488.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_8_568.csv
│   │   │   │   │   ├── Values_9_488.csv
│   │   │   │   │   └── Values_9_568.csv
│   │   │   │   └── Values_CA_N74D_hex_MQW_noCPSF6
│   │   │   │   ├── Values_10_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_10_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_11_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_11_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_12_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_12_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_13_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_13_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_14_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_14_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_15_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_15_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_1_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_1_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_2_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_2_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_3_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_3_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_4_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_4_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_5_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_5_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_6_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_6_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_7_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_7_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_8_488.csv
│   │   │   │   ├── Values_8_568.csv
│   │   │   │   ├── Values_9_488.csv
│   │   │   │   └── Values_9_568.csv
│   │   │   ├── CA_hex
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_5min_then_CPSF6_500uM_post_10min.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_5min_then_CPSF6_500uM_post_15min.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_5min_then_CPSF6_500uM_post_20min.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_5min_then_CPSF6_500uM_post_5min.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_5min_then_CPSF6_500uM_pre_3min.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_5min_then_CPSF6_500uM_pre_5min.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_CPSF6_500uM_preincubated_1hour_after.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_CPSF6_500uM_preincubated_5min_after.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_65uM_CPSF6_500uM_preincubated_7min_after.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_wt_noCPSF6_MQW_high_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_wt_noCPSF6_MQW_high_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_wt_noCPSF6_MQW_high_3.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_wt_noCPSF6_MQW_low_1.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_wt_noCPSF6_MQW_low_2.czi
│   │   │   │   ├── CA_hex_wt_noCPSF6_MQW_low_3.czi
│   │   │   │   └── Values
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│   │   ├── Figure_3_Sup1
│   │   │   ├── Impb_mCherry
│   │   │   │   ├── Nup98_Impb_mCherry_100uM_both_1.czi
│   │   │   │   ├── Nup98_Impb_mCherry_100uM_both_2.czi
│   │   │   │   └── Nup98_Impb_mCherry_100uM_both_3.czi
│   │   │   └── mCherry
│   │   │   ├── Nup98_mCherry_45uM_1.czi
│   │   │   ├── Nup98_mCherry_45uM_2.czi
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│   │   │   └── Nup98_mCherry_45uM_4.czi
│   │   └── Figure_3_Sup_NTF
│   │   ├── 220914_NTF.pzfx
│   │   ├── CA_hex_25uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_10min.czi
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│   │   │   ├── CA_hex_25uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_hex_25uM_5min.czi
│   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_10min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_11min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_12min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_3min.czi
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_4min.czi
│   │   │   └── CA_hex_25uM_Impa_2p5uM_Impb_2p5uM_5min.czi
│   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO1_2p5uM
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│   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM
│   │   │   ├── CA_hex_25uM_TNPO3_2p5uM_10min.czi
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│   │   └── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM
│   │   ├── CA_mon_25uM_TNPO3_2p5uM_10min.czi
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│   └── FFS Data
│   ├── ImpA
│   │   ├── ImpA
│   │   ├── ImpA_02
│   │   ├── ImpA_03
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│   │   ├── TNPO1+CA
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│   │   │   ├── TNPO1+CA.fig
│   │   │   ├── TNPO1+CA.tif
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│   │   ├── TNPO1+CA_repeat
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│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_03_Filtered.csv
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│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_05_Filtered.csv
│   │   │   │   └── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1.fig
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1.tif
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Channel_Alignment.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Density_Plots.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_Scaled_Traces.eps
│   │   │   └── TNPO1+CA+TNPO1_Scaled_Traces.png
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_02
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_03
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_04
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat2_05
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_02
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_03
│   │   ├── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_04
│   │   └── TNPO1+CA+TNPO1_repeat_05
│   ├── TNPO3
│   │   ├── TNPO3
│   │   ├── TNPO3_02
│   │   ├── TNPO3_03
│   │   ├── TNPO3_04
│   │   └── TNPO3_05
│   ├── TNPO3+CA
│   │   ├── TNPO3+CA
│   │   ├── TNPO3+CA_02
│   │   ├── TNPO3+CA_03
│   │   ├── TNPO3+CA_04
│   │   ├── TNPO3+CA_05
│   │   ├── TNPO3+CA_Analysis
│   │   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_05_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_02_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_03_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_04_Filtered.csv
│   │   │   │   ├── TNPO3+CA_repeat_05_Filtered.csv
│   │   │   │   └── TNPO3+CA_repeat_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA.fig
│   │   │   ├── TNPO3+CA.tif
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Channel_Alignment.eps
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Channel_Alignment.png
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Density_Plots.eps
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Density_Plots.png
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Filtered_Raw_Traces.eps
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│   │   │   ├── TNPO3+CA_Filtered_Scaled_Traces.eps
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Filtered_Scaled_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Pooled_Density_Plot.png
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Raw_Traces.eps
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Raw_Traces.png
│   │   │   ├── TNPO3+CA_Scaled_Traces.eps
│   │   │   └── TNPO3+CA_Scaled_Traces.png
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_02
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_03
│   │   ├── TNPO3+CA_repeat2_04
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│   │   ├── TNPO3+CA_repeat_02
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│   │   ├── TNPO3+CA_repeat_04
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│   └── TNPO3+CA+TNPO3
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_02
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_03
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_04
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_05
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Analysis
│   │   ├── Combined_Data.csv
│   │   ├── Correlation_Summary.csv
│   │   ├── Filtered_Data
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_02_Filtered.csv
│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_03_Filtered.csv
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│   │   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_Filtered.csv
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│   │   │   └── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_Filtered.csv
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3.fig
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3.tif
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Channel_Alignment.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Channel_Alignment.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Density_Plots.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Density_Plots.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered_Raw_Traces.eps
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│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Filtered_Scaled_Traces.eps
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│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Pooled_Density_Plot.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Pooled_Density_Plot.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Raw_Traces.eps
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Raw_Traces.png
│   │   ├── TNPO3+CA+TNPO3_Scaled_Traces.eps
│   │   └── TNPO3+CA+TNPO3_Scaled_Traces.png
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_02
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_03
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_04
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat2_05
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_02
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_03
│   ├── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_04
│   └── TNPO3+CA+TNPO3_repeat_05
├── Figure 4
│   ├── Confocal Microscopy
│   │   └── Figure_4
│   │   ├── Nup98_CA_N57A_1.czi
│   │   ├── Nup98_CA_N57A_2.czi
│   │   ├── Nup98_CA_N57A_3.czi
│   │   ├── Nup98_CAwt_1.czi
│   │   ├── Nup98_CAwt_2.czi
│   │   └── Nup98_CAwt_3.czi
│   └── CryoEM data
│   ├── Raw-tilts
│   │   ├── Nup98
│   │   │   ├── nup_15.mdoc
│   │   │   ├── nup_15.mrc
│   │   │   ├── nup_2.mdoc
│   │   │   ├── nup_2.mrc
│   │   │   ├── nup_50.mdoc
│   │   │   ├── nup_50.mrc
│   │   │   ├── nup_51.mdoc
│   │   │   ├── nup_51.mrc
│   │   │   ├── nup_6.mdoc
│   │   │   └── nup_6.mrc
│   │   └── Nup98+CA
│   │   ├── CA_1.mdoc
│   │   ├── CA_1.mrc
│   │   ├── CA_18.mdoc
│   │   ├── CA_18.mrc
│   │   ├── CA_22.mdoc
│   │   ├── CA_22.mrc
│   │   ├── CA_27.mdoc
│   │   ├── CA_27.mrc
│   │   ├── CA_46.mdoc
│   │   ├── CA_46.mrc
│   │   ├── CA_48.mdoc
│   │   ├── CA_48.mrc
│   │   ├── CA_5.mdoc
│   │   ├── CA_5.mrc
│   │   ├── CA_53.mdoc
│   │   ├── CA_53.mrc
│   │   ├── CA_62.mdoc
│   │   └── CA_62.mrc
│   └── Tomograms
│   ├── Nup98
│   │   ├── nup_15_rec.mrc
│   │   ├── nup_2_rec.mrc
│   │   ├── nup_50_rec.mrc
│   │   ├── nup_51_rec.mrc
│   │   └── nup_6_rec.mrc
│   └── Nup98+CA
│   ├── CA_18_rec.mrc
│   ├── CA_1_rec.mrc
│   ├── CA_22_rec.mrc
│   ├── CA_27_rec.mrc
│   ├── CA_46_rec.mrc
│   ├── CA_48_rec.mrc
│   ├── CA_53_rec.mrc
│   ├── CA_5_rec.mrc
│   └── CA_62_rec.mrc
└── Figure 4 Additional
└── CryoEM data N74D
├── Raw-tilts
│   ├── N57D_1.mrc
│   ├── N57D_11.mrc
│   └── N57D_3.mrc
└── Tomograms
├── N57D_11_rec.mrc
├── N57D_1_rec.mrc
└── N57D_3_rec.mrc
403 directories, 4412 files

Sharing/Access information

Links to other publicly accessible locations of the data:

None

Data was derived from the following sources:

Experiments performed at the University of New South Wales, Sydney performed between 2018-2023

Methods

Fluorescence Fluctuation Spectroscopy Data:

Data were collected as described here: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.0c04250?ref=pdf. Fluorescence traces were analyzed using custom software TRISTAN (Two Reagents Incident Spectroscopic Analysis, freely available on https://github.com/lilbutsa/Tristan)

Confocal Microscopy Imaging:

Imaging was performed with Zeiss LSM 880 inverted laser scanning confocal microscope using a 63x oil immersion objective (NA=1.4) (Leica, Bensheim, Germany). The substrate-Nup98 reaction mixes were transferred into a 12 well silicone chamber (Ibidi) on 170 ± 5 µm cover slide. Z-stacks were taken around the centres of the phase separated Nup98 condensates (position with highest diameter) with sequential imaging at 488 and 568. Images were processed using ImageJ and Matlab.

Cryo-Electron Tomography

The grids were imaged on a Talos Arctica electron microscope (Thermo Fisher Scientific) operated at 200 kV acceleration voltage. Cryo-ET data were collected with single-axis tilt on a Falcon III direct electron detector (Thermo Fisher Scientific) in linear mode at a magnification of 28,000x with a pixel size of 5.23 Å.

Tilt series were collected using the dose-symmetric scheme⁸ from -60 to 60° at 3° intervals using Tomography software (Thermo Fisher Scientific) with the defocus value set at -10 µm. Total dose for each tilt series ranged from 60-70 e/Å2. Images of tilt series were binned twofold before tomograms were reconstructed. Three-dimensional reconstructions from tilt series were generated with the IMOD package⁹. Fiducial tracking was used to align the stack of tilted images.

Usage notes

Fluorescence Fluctuation Spectroscopy Data:

Fluorescence traces can be opened with TRISTAN (https://github.com/lilbutsa/Tristan)

Confocal Microscopy Imaging:

.czi files can be opened in ImageJ.

Cryo-Electron Tomography:

.mrc files can be opened in IMOD.

Other:

.pzfx files can be opened in GraphPad Prism

Funding

National Health and Medical Research Council, Award: GNT2013215

Wellcome Trust, Award: 214344/Z/18/Z