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TCGAAGCCTGCAAAGCAGAACGACCCGCGAACATGTTATAACAACCATG-CCAGGATGGGTCGGGCGACAGTTTGATCCTTGTGGCACACCGTCGACGTGCGTCCCTGATGACCCATTGGGCCATCTTGGTCGTT-GCTTCGACGTAACAAAACCCCGGCACTGGATGTGCCAAGGAAATTTAAATTGAAGAATTGTCCGTTCCAAGATCTCCCGTTCGCGGCGTGGTCATGGAGTGTGGCTTCTTTGTAATCACAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCACGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTCGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCGCGTCGCTCCCACCAACCCTTCCTTTGGGATGCTTGGCTGGGGGCGGATACTGGTCTCCCGTTTCTCACCGTGCGGTTGGCCAAAATAAGAGTCCCT-GTTGACGGGCACATGACTAGTGGTGGTTGACAAAACCTGGAATCGTGTCGTGTGCCTCGTCAAAAGGGTGCATCATAATTGACCCAACGCGTTGTCATGTTACG-ACGCTTCGACC [ETS indels 4 chars, ITS indels 13 chars] Archibaccharis_asperifolia_KX063950.1 01001011101100010 Diplostephium_cinereum_KX063999.1 01001011101111000 Diplostephium_ericoides_KX064026.1 01001011101111010 Hinterhubera_ericoides_KX063974.1 01001011101111010 Laennecia_sophiifolia_KX064011.1 01001011101111010 Lagenophora_cuchumatanica_KX064034.1 01101011101111010 Baccharis_pilularis_H4578 01001011101111110 Baccharis_salicifolia_AA1983 01001011101111010 Oclemena_nemoralis_LB1 01001011101111010 Arida_carnosa_GU480694.1 01001010000011010 Eurybia_conspicua_GU480665.1 01001010001111010 Eurybia_macrophylla_GU480669.1 01001010001111010 Eurybia_radula_GU480659.1 01011011001111010 Herrickia_glauca_pulchra_GU480679.1 00001010001111010 Herrickia_kingii_barnebyana_GU480675.1 01001010001111010 Machaeranthera_tanacetifolia_GU480688.1 01000010000011010 Oreostemma_alpigenum_alpigenum_GU480681.1 11001000001111010 Oreostemma_peirsonii_GU480684.1 11001010001111010 Doel_infirma_S10716 01001011101111010 Doel_sericocarpoides_S10531 01001011101111010 Doel_umbellata_S11044 01001011101111010 Doel_umbellata_SS11185 01001011101111010 Doel_umbellata_G21464 01001011101111010 Euceph_breweri_SH8736 01001011101111010 Euceph_breweri_E7865 01001011101111010 Euceph_elegans_B10488 01001011101111010 Euceph_elegans_H19500 01001011101111010 Euceph_elegans_GD1844 01001011101111010 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Bayesian analysis of final Doell + Euceph sequences (18 outgroup incl seqs from Vargas paper, old Diplo ericoides & Laennecia scheideana deleted; 26 ingroup); indels coded] begin mrbayes; Charset sequence = 1-1122; Charset indels = 1123-1139; Partition Datanames = 2: sequence, indels; Set partition=Datanames; Lset applyto=(1) nst=6 rates=invgamma; Lset applyto=(2) coding=variable rates=gamma; Unlink shape=(all) pinvar=(all) statefreq=(all) revmat=(all); Prset ratepr=variable; End;