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Astacopsis_tricornis 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Astacus_astacus 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Astacus_leptodactylus 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Barbicambarus_cornutus 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Barbicambarus_simmonsi 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Bouchardina_robisoni 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Cambarellus_blacki 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Cambarellus_chapalanus 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Cambarellus_diminutus 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Cambarellus_lesliei 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Cambarellus_montezumae 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Cambarellus_ninae ----------------------------------------TACTAGAATATTAAAAGTTATGGTCTTTAAATTTAAAAAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTAGTTAGAGGAACCTGTTTTTTAAACGATACAACACGCATTATTTTACTTATTCTAGTA-TAAACAGTTTGTATACCGTCATTAT-AAGATAA-TTTAGGAGAAGATATTATTA-GAATC--ATAT-T--A-T-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATGAGTAAGTAAATATGGGTTACAATAAAATTTATTTAT-TATGGATTAGGTATTTAAAT-A-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG-AAGAGA-AGTAGTAAGGTTTTCTGATAGAAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGTTGGACAAGAAATAATCTGTCTT-AAT-TAA-AAATA-TTGAATTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATAATTTGAGGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATG-TT--T--AATA--AT-AG--T-A-GTTAATT--TT-G-T-T-TT-----GG-T-T-TA-TTA--T---T--TAAA-AGCATTT-GGTTGGGGTGACAAAGATAAAA-TTAATAGTAACTG-TC---T--T--TAT--AT---T---TA-A--CAGTGATATCT-GG---G--T-TTATGAT-CCTCA---AA-AGG-A---TT-G-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTCTTTAAGAGTTCTTATCGACAAGAAAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAA-GTTCATTATAGAGTAGAGACTAT-AATA-GAAGGTCTGTTCGA-CCTTTAAAGTTTTACATGATTTGAGTTCAGACCGGTGTGAG-------------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCAAACGGGTGGAACCTCGAAGGTCGAACTGG-GGGATTCAGCTCGTCGGCTGT-CGGCTGGGTGGGGA----------CGT-------AAC--------AAAGCGACC-CAGG---AATGCTTGGG-CGTG-CCTC--CACCCA-CGCCGGCGTCGGC-GGGCGTATTTCGCCTCACAGTAGGTCGCCGCGACCCGT------TGCTTT-CGGGGA---CGTC---TAAGGCCCG---GACGGATTGGTACCCTA------CC----GGCTGGGGATGCGGC---------------------------------------------------------------TTCGGCT--TCTCCTCT------------------------------TGTCCGGTGGGCGAAACCGCC---GGTG-------TCCTGGCTG-CCCTGCGACGGTCGTAGAGACGAGC-CCT-------------------CCTCTCATTC---GT---------GGGGGG--------------TCGGCTCTCGCGGCGTGC-AAAAGGTCGGTGATCCACCCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGTGCGAGTCAGTGGGCGC----ACTAAACCCAGAGGCGTAATGAAAGTG-----------------AC------------ACGGGTTCG---GCTGTC-------GCCTCG--------------TGTG---GCAGCCG-GAC---TC---------------A-GGCCGATCCCT-CACCGGTTGGCC-TC-----------GCC----TCT-C----TT---CGCG------------TCTCGGT-------AGCCGGGT-GAGCTAT-TTTCCCC---GGC----CGCTGCT-----GCGG-GCTCG--GG---------GGGA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------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Cambarellus_occidentalis 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Cambarellus_patzcuarensis 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Cambarellus_prolixus ----------------------------------------TACTAGAATATTAAAAGTTATGGTCTTTAAATTTAAAAAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTAGTTAGAGGAACCTGTTTTATAAACGATACAACACGCATTATTTTACTTATTTTAGTG--GAGCAGTTTGTATACCGTCATTAT-AAGATAA-TTTAGGAGAAAATATTATTG-AAATC--ATAT-T--T-G-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATAGATAAGTAAATATGGGTTACAATAAAATTTATTTAA-TATGAATTAAGTATTTAAAT-A-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG-GGAAGG-AGTAGTGAGATTTTCTGATAAAAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGTTGGACAAGAAATAATCTGTCTT-AAT-TGA-AAATA-TTGAATTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATAATTTGGGGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATA-TT--T--GGGG--GT-AA--T-A-GTTAATT--TT-G-T-T-TT-----AT-T-T-TA-TTA--T---T--TAAA-AGTATTT-GGTTGGGGCGACGAGGATATAA-TATATAATAACTG-TT---C--T--TGT--TT---A---TA-A--CAATGCTATTT-GG---T--T-TTATGAT-CCTGA--TAA-CGG-A---TT-A-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTTTTTAAGAGTTCTTATCGACAAAAAAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAA-GTTCTTTATAAAGTAGAGATTAT-AAGA-GAGGGTCTGTTCGA-CCTTTAAAATTTTACATGATTTGAGTTCAGACCGGTGTGAG-------------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCAAACGGGTGGAACCTCGAAGGTCGAACTGG-GGGATTCAGCTCGTCGGCTGT-CGGCTGGGTGGGGA----------CGT-------AAC--------AAAGCGACC-CAGG---AATGCTTGGG-CGTG-CCTC--CACCCA-CGCCGGCGTCGGC-GGGCGTATTTCGCCTCACAGTAGGTCGCCGCGACCCGT------TGCTTT-CGGGGA---CGTC---GAAGGCCCG---GACGGATTGGTACCCTA------CC----GGCTGGGGATGCGGC---------------------------------------------------------------TTCGGCT--TCTCCTCT------------------------------TGTCCGGTGGGCGAAACCGCC---GGTG-------TCCTGGCTG-CCCTGCGACGGTCGTAGAGACGAGC-CCT-------------------CACCCCATTC---GT---------GGGGGGA-------------GCGGCTCTCGCGGCGTGC-AAAAGGTCGGTGATCCACCCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGTGCGAGTCAGTGGGCGC----ACTAAACCCAGAGGCGTAATGAAAGTG-----------------AC------------ACGGGTTCG---GCTGTC-------GCCTCG--------------TGTG---GCAGCCG-GAC---TC---------------AGGGCCGATCCCT-CACCGGTTGGCC-TC-----------GCC----TCT-C----TT--CCGCG------------TCTCGGTA------AGCCGGGT-GAGCTAT-TTTCCCC---GGC----CGCTGCT-----GCGG-GGCTC--GG---------GGGG---------A------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------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Cambarellus_puer ----------------------------------------TACTAGAATATTAAAAGTTATGGTCTTTAAATTTAAAAAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTAGTTAGAGGAACCTGTTTTTTAAACGATACAACACGCATTATTTTACTTATTCTAGTA-TAAACAGTTTGTATACCGTCATTAT-AAGATAA-TTTAGGAGAAGATATTATTA-GAATC--ATAT-T--A-T-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATGAGTAAGTAAATATGGGTTACAATAAAATTTATTTAT-TATGGATTAGGTATTTAAAT-A-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG-AAGAGA-AGTAGTAAGGTTTTCTGATAGAAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGATGGACAAGAAATAATCTGTCTT-AAT-TAA-AAATA-TTGAATTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATAATTTGAGGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATG-TT--T--AATA--AT-AG--T-A-GTTAATT--TT-G-T-T-TT-----GA-T-T-TA-TTA--T---T--TAAA-AGCATTT-GGTTGGGGTGACAAGGATAAAA-TTAATAGTAACTG-TC---T--T--TTT--AT---T---TA-A--CAGTGATATCT-GG---G--T-TTATGAT-CCTC----AA-AGG-A---TT-G-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTCTTTAAGA--TTTTATCGACAAGAAAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAA-GTTCATTATAGAGTAGAGACTAT-AATA-GAAGGTCTGTTCGA-CCTTTAAAGTTTTACATGATTTGAGTTC-GACCGGTGTGAG-------------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCAAACGGGTGGAACCTCGAAGGTCGAACTGG-GGGATTCAGCTCGTCGGCTGT-CGGCTGGGTGGGGA----------CGT-------AAC--------AAAGCGACC-CAGG---AATGCTTGGG-CGTG-CCTC--CACCCA-CGCCGGCGTCGGC-GGGCGTATTTCGCCTCACAGTAGGTCGCCGCGACCCGT------TGCTTT-CGGGGA---CGTC---TAAGGCCCG---GACGGATTGGTACCCTA------CC----GGCTGGGGATGCGGC---------------------------------------------------------------TTCGGCT--TCTCCTCT------------------------------TGTCCGGTGGGCGAAACCGCC---GGTG-------TCCTGGCTG-CCCTGCGACGGTCGTAGAGACGAGC-CCT-------------------CCTCTCATTC---GT---------GGGGGG--------------TCGGCTCTCGCGGCGTGC-AAAAGGTCGGTGATCCACCCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGTGCGAGTCAGTGGGCGC----ACTAAACCCAGAGGCGTAATGAAAGTG-----------------AC------------ACGGGTTCG---GCTGTC-------GCCTCG--------------TGTG---GCAGCCG-GAC---TC---------------AGGGCCGATCCCT-CACCGGTTGGCC-TC-----------GCC----TCT-C----TT--CCGCG------------TCTCGGTA------AGCCGGGT-GAGCTAT-TTTCCCC---GGC----CGCTGCT-----GCGG-GGCTC--GG---------GGGG---------A------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------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Cambarellus_schmitti -----------TAGTACACTTAAA-TTTAAT-TCAA-AAGTACTAGAATATTAAAAGTTATGGTCTTTAAATTTAAAAAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTAGTTAGAGGAACCTGTTTTTTAAACGATATAACACGCATTATTTTACTTATTTTAGTA--TAACAGTTTGTATACCGTCATTAT-AAGATAA-TTTAGGAGAAGATATTATTA-GAATC--ATAT-T--A-T-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATGAGTAAGTAAATATGGGTTACAATAAGATTTATTTAT-TATGGATTAGGTGTTTAAAT-A-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG-AAGAGA-AATAGTAAGGTTTTCTGATAAAAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGCTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGTTGGACAAGAAATAACCTGTCTT-AAT-TAA-AAATA-TTGAATTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATGATTTGAAGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATA-TT--T--GATA--TT-AA--T-A-ATTAATT--TT-G-T-T-TT-----AA-T-T-TA-TTA--T---T--TAAA-AATATTT-GGTTGGGGTGACAAGGATAAAA-TGAGTAATAACTG-TT---T--T--TTT--AT---T---TA-A--CAATGATATTT-GG---G--C-CAATGAT-CCTCA---AA-AGG-A---TT-G-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTCTTTAAGAGTTCTTATCGACAAGAAAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAA-GTTCATTATAGAGTAGAGACTAT-AATA-GAAGGTCTGTTCGA-CCTTTAAAGTTTTACATGATTTGAGTTCAGACCGGTGTGAG-------------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCAGCTCGTCGGCTGT-CGGCTGGGTGGGGA----------CGT-------AAC--------AAAGCGACC-CAGG---AATGCTTGGG-CGTG-CCTC--CACCCA-CGCCGGCGTCGGC-GGGCGTATTTCGCCTCACAGTAGGTCGCCGCGACCCGT------TGCTTT-CGGGGA---CGTC---TAAGGCCCG---GACGGATTGGTACCCTA------CC----GGCTGGGGATGCGGC---------------------------------------------------------------TTCGGCT--TCTCCTCT------------------------------TGTCCGGTGGGCGAAACCGCC---GGTG-------TCCTGGCTG-CCCTGCGACGGTCGTAGAGACGAGC-CCT-------------------TC-CCCATTC---GT---------GGGGGG--------------GCGGCTCTCGCGGCGTGC-AAAAGGTCGGTGATCCACCCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGTGCGAGTCAGTGGGCGC----ACTAAACCCAGAGGCGTAATGAAAGTG-----------------AC------------ACGGGTTCG---GCTGTC-------GCCTCG--------------TGTG---GCAGCCG-GAC---TC---------------AGGGCCGATCCCT-CACCGGTTGGCC-TC-----------GCC----TCT-C----TT--CCGCG------------TCTCGGTA------AGCCGGGT-GAGCTAT-TTTCCCC---GGC----CGCTGCT-----GCGG-GGCTC--GG---------GGGG---------AGG----CGGGG-TGCGATG-----GTGTCCGT---------AAAAAAGA------------GCCTGCTT-T-TG------------CAGG--GGGGCGCAGGCCCGGGACTTGCCA---GGACGCCGC------GAGA-----------C---TG---TCAC-T------TT---GCT----------------------------------------------------------GTGAGGC---------------------TCCAGGGC------------------------------------------------------------------------------------CGATCAGCG---------------GGTCAT-------GCG-TGCAGTCGGCA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Cambarellus_shufeldtii 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Cambaroides_dauricus 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Cambaroides_japonicus 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Cambaroides_schrenckii 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Cambaroides_similis 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Cambarus_acanthura 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Cambarus_aculabrum 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Cambarus_acuminatus 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Cambarus_asperimanus 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Cambarus_bouchardi 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Cambarus_brachydactylus 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Cambarus_chasmodactylus 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Cambarus_coosae 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Cambarus_coosawattae -----------------------------------------------------------------------TTTAAAGAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTGGTTAGAGGAACCTGTGTTATAAATGATACGACACGCATCATCTTACTTATTTTAGTA--AATCAGTTTGTATACCGTCATTAT-TAGATAA-TTTATGAGAAAATATTATTA-AGATC--ATAT-T--A-T-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATGAGTAAGTAAATATGGGTTACAATAAAATTTATTTAA-TATGAATTAGGTATTTAAAT-A-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG--AAAAA-AATAGTAAGATTTTTTGATAAAAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGTTGGACAAGAAGCAAACTGTCTT-TGG-TTA-ATATA-TTGAATTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATAATCTGAAGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATA-TT--G--A-GAA-GT-AAT-G-G-GCAGGTT--TT-G-T-T-TA-----GA-A-GTTA-TTA-TT---T--TTAG-AGTATTT-GGTTGGGGCGACAAGGATAAAA--AGAAAGTAACTG-TT---C--T--TTT--AT---T---TT-A--CAATAATGTTTGGG---T--A-TAATGAT-CCTA---ATA-TGG-A---TT-A-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTCTTTGAGAGTTCTTATCGATAAGAGAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAG-GTTCTTTATGGAGTAGAGACTAT-AAGA-GAAGGTCTGTTCGA-CCTTTAAAACTTTACATGATTTGAGTTCA-------------------------------??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Cambarus_cracens 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Cambarus_crinipes 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Cambarus_cryptodytes 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Cambarus_cumberlandensis 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Cambarus_davidi 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Cambarus_diogenes 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Cambarus_distans 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Cambarus_dubius 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Cambarus_englishi 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Cambarus_gentryi 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Cambarus_georgiae 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Cambarus_girardianus 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Cambarus_graysoni 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Cambarus_halli 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Cambarus_hamulatus 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Cambarus_harti 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Cambarus_hiwasseensis 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Cambarus_hobbsorum 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Cambarus_howardi 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Cambarus_hubbsi 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Cambarus_jonesi 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Cambarus_laconensis 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Cambarus_longirostris 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Cambarus_ludovicianus 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Cambarus_maculatus 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Cambarus_manningi 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Cambarus_miltus 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Cambarus_monongalensis 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Cambarus_nerterius 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Cambarus_obeyensis 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Cambarus_obstipus 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Cambarus_parrishi 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Cambarus_pristinus 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Cambarus_pyronotus 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Cambarus_reburrus 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Cambarus_reflexus 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Cambarus_robustus 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Cambarus_rusticiformis 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Cambarus_sciotensis 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Cambarus_scotti 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Cambarus_setosus 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Cambarus_speleocoopi 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Cambarus_striatus 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Cambarus_strigosus 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Cambarus_tartarus 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Cambarus_tenebrosus 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Cambarus_truncatus 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Cambarus_tuckasegee 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Cambarus_unestami 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Cambarus_williami 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Cherax_cainii 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Cherax_cairnsensis 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Cherax_crassimanus 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Cherax_cuspidatus 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Cherax_glaber 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Cherax_punctatus 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Cherax_quadricarinatus 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Cherax_quinquecarinatus 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Cherax_rhynchotus 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Cherax_robustus 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Cherax_rotundus 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Cherax_setosus 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Cherax_tenuimanus 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Distocambarus_carlsoni 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Distocambarus_devexus 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Engaeus_cisternarius 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Engaeus_cunicularius 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Engaeus_curvisuturus 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Engaeus_cymus 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Engaeus_disjuncticus 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Engaeus_fossor 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Engaeus_fultoni 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Engaeus_granulatus 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Engaeus_hemicirratulus 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Engaeus_karnanga 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Engaeus_laevis 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Engaeus_quadrimanus 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Engaeus_rostrogaleatus 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Engaeus_sericatus 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Engaeus_spinicaudatus 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Engaeus_sternalis 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Engaeus_strictifrons 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Engaeus_tayatea 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Engaeus_tuberculatus 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Engaeus_urostrictus 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Engaeus_victoriensis 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Engaeus_yabbimunna 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Engaewa_reducta 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Euastacus_australasiensis 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Euastacus_claytoni 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Euastacus_eungella 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Euastacus_fleckeri 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Euastacus_gamilaroi 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Euastacus_gumar 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Euastacus_guwinus 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Euastacus_maidae 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Euastacus_mirangudjin 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Euastacus_sulcatus 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Euastacus_valentulus 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Creaserinus_burrisi 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Creaserinus_byersi 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Creaserinus_caesius 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Creaserinus_danielae 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Fallicambarus_devastator 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Fallicambarus_dissitus 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Creaserinus_fodiens 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Creaserinus_gilpini 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Creaserinus_gordoni 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Fallicambarus_harpi 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Creaserinus_hortoni 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Fallicambarus_houstonensis 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Fallicambarus_macneesei 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Fallicambarus_petilicarpus 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Fallicambarus_strawni 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Fallicambarus_wallsi 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Faxonella_blairi 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Faxonella_clypeata 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Hobbseus_petilus 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Hobbseus_prominens 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Orconectes_barri 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Faxonius_burri 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Faxonius_carolinensis 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Faxonius_causeyi 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Faxonius_chickasawae 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Faxonius_compressus 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Faxonius_cooperi 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Faxonius_cristavarius 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Faxonius_deanae 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Faxonius_difficilis 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Faxonius_durelli 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Faxonius_erichsonianus 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Faxonius_etnieri 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Faxonius_eupunctus 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Faxonius_forceps 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Faxonius_harrisonii 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Faxonius_hartfieldi 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Faxonius_hobbsi 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Faxonius_hylas 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Faxonius_jeffersoni 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Faxonius_jonesi 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Faxonius_juvenilis 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Faxonius_kentuckiensis 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Faxonius_lancifer 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Faxonius_leptogonopodus 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Faxonius_limosus 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Faxonius_longidigitus 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Faxonius_luteus 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Faxonius_macrus 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Faxonius_maletae 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Faxonius_medius 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Faxonius_meeki_brevis 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Faxonius_meeki_meeki 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Faxonius_menae 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Faxonius_mirus 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Faxonius_mississippiensis 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Faxonius_nais 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Faxonius_nana 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Faxonius_neglectus_neglectus 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Faxonius_obscurus 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Faxonius_ozarkae 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Faxonius_pagei 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Faxonius_palmeri_longimanus 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Orconectes_pellucidus 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Faxonius_perfectus 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Faxonius_peruncus 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Faxonius_propinquus 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Faxonius_punctimanus 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Faxonius_putnami 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Faxonius_quadruncus 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Faxonius_quinebaugensis 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Faxonius_rafinesquei 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Faxonius_rhoadesi 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Faxonius_rusticus 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Faxonius_sanbornii 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Faxonius_spinosus 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Faxonius_stannardi 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Orconectes_stygocaneyi 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Faxonius_tricuspis 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Faxonius_validus 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Faxonius_virginiensis 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Faxonius_virilis 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Faxonius_williamsi 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Faxonius_wrighti 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Pacifastacus_connectens 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Pacifastacus_fortis 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Pacifastacus_leniusculus_leniusculus 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Pacifastacus_leniusculus_trowbridgii 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Paranephrops_zealandicus 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Parastacus_pugnax 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Parastacus_varicosus 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Procambarus_achilli 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Procambarus_advena 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Procambarus_ancylus 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Procambarus_apalachicolae 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Procambarus_bivittatus 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Procambarus_bouvieri 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Procambarus_braswelli 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Procambarus_caballeroi 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Procambarus_capillatus 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Procambarus_caritus 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Procambarus_ceruleus 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Procambarus_chacalli 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Procambarus_clemmeri 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Procambarus_contrerasi 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Procambarus_cubensis_cubensis 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Procambarus_delicatus 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Procambarus_dupratzi 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Procambarus_econfinae 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Procambarus_enoplosternum 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Procambarus_epicyrtus 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Procambarus_erichsoni 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Procambarus_evermanni 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Procambarus_franzi 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Procambarus_geodytes 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Procambarus_gibbus 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Procambarus_hirsutus 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Procambarus_hoffmani 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Procambarus_horsti 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Procambarus_hortonhobbsi 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Procambarus_howellae 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Procambarus_incilis 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Procambarus_kensleyi 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Procambarus_leonensis 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Procambarus_lepidodactylus 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Procambarus_liberorum 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Procambarus_litosternum 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Procambarus_llamasi 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Procambarus_lucifugas_lucifugas 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Procambarus_lucifugus_alachua 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Procambarus_lunzi 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Procambarus_luxus 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Procambarus_pallidus 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Procambarus_paradoxus 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Procambarus_parasimulans 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Procambarus_pearsei 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Procambarus_pictus 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Procambarus_pubischelae_deficiens 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Procambarus_pygmaeus 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Procambarus_regalis 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Procambarus_roberti 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Procambarus_rogersi_campestris 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Procambarus_rogersi_expletus 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Procambarus_rogersi_rogersi 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Procambarus_seminolae 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Procambarus_shermani -----------TAGTACACTTAGA-TTTAAT-TTAC-GAATACTAGAATATTAGGAGTTATGTTCTTTAAATTTAAAAAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTAGTTAGAGGAACCTGTTTTATAAACGATACAACACGCATTATTTTACTTATTTTAGTA--AATCAGCTTGTATACCGTCATTAT-AAGATAA-TTTAGGAGAAAATATTATTG-TAATC--ATAT-T--A-T-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATAGATAAGTAAATATGGGTTACAATAAAATTTATTTAA-TATGAATTAAGTGTTTAAAT-A-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG-GAGAGG-AGTAGTGAGGTTTTCTGATGTTAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGTTGGACAAGAAATAATCTGTCTT-AAA-AAA-ATAAA-TTGAATTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATGATCTGAAGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATA-TT--T--TTGAT-AT-AG--T-A-GTTAGTT--TT-A-T-T-TA-----AG-A-G-TA-TTA--T---T--TTAA-AATATTT-GGTTGGGGTGACAAGGATAAAA-TATATAATAACTG-TC---T--T--TTT--TT---T---TT-A--CAGTAATGTTT-GG---T--T-TAGTGAT-CCTA---GAA-GGG-A---TT-A-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTCTTTAAGAGTTCTTATCGACAAGAAAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAA-GTTCTTTATAGAGTAGAGACTAT-AGTA-GAAGGTCTGTTCGA-CCTTTAAAATTTTACATGATTTGAGTTCAGACCGGTGTGAG-------------------------------TGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAAGTACAAGCCGAGTTAAGGCGAAACCGCGAATGGCTCATTAAATCAGCTATGTTTCATTGGATCT-GTAAA-CCCACTTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATG--CAT--CACGTCTCTGACCGCAAGGGAAGAGCGCTTTTATTAGTTCAAAACTGGTCGGGCCTCGGTCCGTTAACCCACCCGTGGTGAATCTGAATAACTTTTTGCTGAGCGCACGGTCTCCGCACCGGCGCCGCATCCTTCAAGTGTCTGCCTTATCAGCTTTCGATTGTAGGTTATGCGCCTACAATGGCTATAACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCACTCCCGGCACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATGCGAGACTCATCCGAGGCCTCGCAATCGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTCAGTTCCGGACTGACG------GTACACCG-CCT--GGTGCTTACTGTCACGCTCCGAACAGCT------AAC---------------TAGCCCCGCCGGCTCGCACGGGGTGCTCTTCATCGAGTGTCCCGAGTGGCCGGCACGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCAGAGCAGGCTACTTTAATGGCCTGAATGT--CTATGCA-TGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTT-TG-TT--GGTTTT-CGGAACCTGAGGTAATGACTAATAGAAACAGGCGGGGGCATTCGTATTGCGACGCTAGAGGTGAAATTCTTGGACCGTCGCAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCAACTAGCGATCCGCCGGCGTTATTCCCATGACCCGGCGGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGTATTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAACCTCACCAGGCCCAGACACCGGAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTGGCCTATTAACTAGTCGACGGATCTCCAGCAATTGGTGTCCAGTTCGCAACTTCTTCTTAGAGGGATTAGCGGCAATTCTAGCCGCACGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGAGATCAACGTGTTCT-CCCCCTCCGAGAGGAGCGGGTAACCCGTTCAATCCCCTTCATGATAGGGATTGGGGCTTGCAATTGTTTCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGTGCAAGTCATCAGCTTGCGCTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGATTTAGTGAGGCCTTCGGACTGGCGCTCTTGGAT------GT--TCTACCCC-T---CGCG---------TC---T-----CGGC-------------G-CAAGGGG----TTCTCGCCTCGAGCTGACGGAAAGATGTCCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCAAACGGGTGGAACCTCGAAGGTCGAACTGG-GGGATTCAGCTCGTCGGCTGT-CGGCTGGGTGGGGA----------CGT-------AAC--------AAAGCGACC-CAGG---AATACTTGGG-CGTG-CCTC--CACCCA-CGCCGGCGTCGGC-GGGCGTATTTCGCCTCACAGTAGGTCGCCGCGACCCGT------TGCTTT-TGGGGA---CGTC---GAAGGCCCG---GACGGATTGGTACCCTA------CC----GGCTGGGGATGCGGC---------------------------------------------------------------TTCGGCT--TCTCCTCT------------------------------TGTCCGGTGGGCGAAACCGCC---GGTG-------TCCTGGCTG-CCCTGCGACGGTCGTAGAGACGAGC-CCC-------------------T--CCCATTC---GT---------GGGGG---------------GCGGCTCTCGCGGCGTGC-AAAAGGTCGGTGATCCACCCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGTGCGAGTCAGTGGGCGC----ACTAAACCCAGAGGCGTAATGAAAGTG-----------------AC------------ACGGGTTCG---GCTGTC-------GCCTCG--------------TGTG---GCAGCCG-GAC---TC---------------AGGGCCGATCCCT-CACCGGTTGCCC-TC-----------GCCT--CTCT-C----TT--CCGCG------------TCTCGGTA------AGCCGGGT-GAGCTAT-TTTCCCC---GGC----CGCTGCT-----GCGG-GGCGC--GG---------GGGG---------AGG----CGGGG-TGCGATG-----GTGTCCGT---------AAAAAAGA------------GCCTGCTG-T-TG------------CAGG--GGGGCGCAGGCCCGGGACTTGCCA---GGACGCCGC------GAGA-----------C---TG---TCAC-T------TT---GCT----------------------------------------------------------GTGAGGC---------------------TCCAGGGC------------------------------------------------------------------------------------CGATCAGCG---------------GGTCAT-------GCG-TGCAGTCGGCA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Procambarus_simulans -----------TAGTACACTTAAA-TTTAAT-TTAT-ATTTACTAGAGTATTAAAAGTTATGTTCTTAAAATTTAAAAAATTTGGCGGTGTTTTAGTCTAGTTAGAGGAACCTGTATTATAAACGATATAACACGAATTATTTTACTTGTTTTGGTA---AACAGTTTGTATACCGTCATTAT-AAGATAA-TTTAAGAGAGAATATTATTA-AGATC--AAAT-T--A-T-TGAGTATATTAGATCAAGGTGCAGCTTATAAATAAGTAAATATGGGTTACAATAAAATTTATTTAA-TATGGATTAAGTATTTAAAT-G-TATTTATGAAGGAGGATTTAATTGTAAG-AGGAGG-AGTAGTAAGATTTTCTGATATAAGCTCTAAATTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTTT-AATTGAAGGCTAGAATG-AATGGTTGGACAAGAAATAATCTGTCTT-AAT-TAA-ATATA-TTGAACTTAACTTTTAA-GTGAAAAGGCTTAAATAATCTGAAGGGACGATAAGACCCTATAAAAC-TTT--ATA-TT--T--ATAAGATT-AA--T-A-GTTAATT--TT-A-T-T-TT-----AA-T-A-TA-TTA--T---T--TTAA-AATATTT-TGTTGGGGTGACAAGGATAAAA-TTAAAAGTAACTG-TC---C--T--TTT--TT---A---TT-A--CAGTAATGTCT-GG---T--T-TAATGAT-CCTTA---AA-TGG-A---TT-A-AAGATTAAGTTACTTTAGGG-ATAACA-GCG--TAA-TTTTCTTTAAGAGTTCTTATCGACAAGAAAGTTT-GC-GACCTCGATGTTGAATTAAAA-GTTCTTTATAGAGTAGAGACTAT-AAAA-GAAGGTCTGTTCGA-CCTTTAAATTTTTACATGATTTGAGTTCAGACCGGTGTGAG-------------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGA----------CGT-------AAC--------AAAGCGACC-CAGG---AATGCTTGGG-CGTG-CCTC--CACCCA-CGCCGGCGTCGGC-GGGCGTATTTCGCCTCACAGTAGGTCGCCGCGACCCGT------TGCTTT-TGGGGA---CGTC---GAAGGCCCG---GACGGATTGGTACCCTA------CC----GGCTGGGGATGCGGC---------------------------------------------------------------TTCGGCT--TCTCCTCT------------------------------TGTCCGGTGGGCGAAACCGCC---GGTG-------TCCTGGCTG-CCCTGCGACGGTCGTAGAGACGAGC-CCT-------------------T--CCCATTC---GT---------GGGGG---------------GTGGCTCTCGCGGCGTGC-AAAAAGTCGGTGATCCACCCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGTGCGAGTCAGTGGGCGC----ACTAAACCCAGAGGCGTAATGAAAGTG-----------------AC------------ACGGGTTCG---GCTGTC-------GCCTCG--------------TGTG---GCAGCCG-GAC---TC---------------AGGGCCGATCCCT-CACCGGTTGGCC-TC-----------GCC----TCT-C----TC--CCGCG------------TCTCGGTA------AGCCGGGT-GAGCTAT-TTTCCCC---GGC----CAATGCT-----GCGG-GGCTC--GG---------GGGG---------AGG----CGGGG-TGCGATG-----GTGTCCGT---------AAAAAAGA------------GCCTGCTG-T-TG------------CAGG--GGGGCGCAGGCCCGGGACTTGCCA---GGACGCCGC------GAGA-----------C---TG---TCAC-T------TT---GCT----------------------------------------------------------GTGAGGC---------------------TCCAGGGC------------------------------------------------------------------------------------CGATCAGCG---------------GGTCAT-------GCG-TGCAGTCGGCA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Procambarus_spiculifer 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Procambarus_steigmani 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Procambarus_strenthi 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Procambarus_suttkusi 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Procambarus_talpoides 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Procambarus_tenuis 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Procambarus_toltecae 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Procambarus_troglodytes 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Procambarus_truculentus 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Procambarus_tulanei 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Procambarus_versutus 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Procambarus_vioscai_paynei 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Procambarus_youngi 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Virilastacus_rucapihuelensis 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; END; BEGIN SETS; CHARSET 12S = 1-424; CHARSET 16S = 425-1050; CHARSET 18S = 1051-3010; CHARSET 28S = 3011-7056; CHARSET COI = 7057-7662; CHARSET H3 = 7663-7995; ## Best-fit partitioning scheme determined by PartitionFinder # 12S_16S = 1-424, 425-1050 # 18S_H3-pos2 = 1051-3010, 7664-7995\3 # 28S = 3011-7056 # COI-pos1_COI-pos2_H3-pos1 = 7057-7662\3, 7058-7662\3, 7663-7995\3 # COI-pos3 = 7059-7662\3 # H3-pos3 = 7665-7995\3 END;